Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDQ0

HAVCR2, Hepatitis A virus cellular receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAVCR2Q8TDQ0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HAVCR2Q8TDQ0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HAVCR2Q8TDQ0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HAVCR2Q8TDQ0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HAVCR2Q8TDQ0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HAVCR2Q8TDQ0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HAVCR2Q8TDQ0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HAVCR2Q8TDQ0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HAVCR2Q8TDQ0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HAVCR2Q8TDQ0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HAVCR2Q8TDQ0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HAVCR2Q8TDQ0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HAVCR2Q8TDQ0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HAVCR2Q8TDQ0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HAVCR2Q8TDQ0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HAVCR2Q8TDQ0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HAVCR2Q8TDQ0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HAVCR2Q8TDQ0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HAVCR2Q8TDQ0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HAVCR2Q8TDQ0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HAVCR2Q8TDQ0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HAVCR2Q8TDQ0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HAVCR2Q8TDQ0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HAVCR2Q8TDQ0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HAVCR2Q8TDQ0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HAVCR2Q8TDQ0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HAVCR2Q8TDQ0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HAVCR2Q8TDQ0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HAVCR2Q8TDQ0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HAVCR2Q8TDQ0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HAVCR2Q8TDQ0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HAVCR2Q8TDQ0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HAVCR2Q8TDQ0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HAVCR2Q8TDQ0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HAVCR2Q8TDQ0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HAVCR2Q8TDQ0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HAVCR2Q8TDQ0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HAVCR2Q8TDQ0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HAVCR2Q8TDQ0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HAVCR2Q8TDQ0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HAVCR2Q8TDQ0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HAVCR2Q8TDQ0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HAVCR2Q8TDQ0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HAVCR2Q8TDQ0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HAVCR2Q8TDQ0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HAVCR2Q8TDQ0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HAVCR2Q8TDQ0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HAVCR2Q8TDQ0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HAVCR2Q8TDQ0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HAVCR2Q8TDQ0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HAVCR2Q8TDQ0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HAVCR2Q8TDQ0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HAVCR2Q8TDQ0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HAVCR2Q8TDQ0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HAVCR2Q8TDQ0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HAVCR2Q8TDQ0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HAVCR2Q8TDQ0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HAVCR2Q8TDQ0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HAVCR2Q8TDQ0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HAVCR2Q8TDQ0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HAVCR2Q8TDQ0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HAVCR2Q8TDQ0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HAVCR2Q8TDQ0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HAVCR2Q8TDQ0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HAVCR2Q8TDQ0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HAVCR2Q8TDQ0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HAVCR2Q8TDQ0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HAVCR2Q8TDQ0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HAVCR2Q8TDQ0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HAVCR2Q8TDQ0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HAVCR2Q8TDQ0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HAVCR2Q8TDQ0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HAVCR2Q8TDQ0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HAVCR2Q8TDQ0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HAVCR2Q8TDQ0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HAVCR2Q8TDQ0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HAVCR2Q8TDQ0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HAVCR2Q8TDQ0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HAVCR2Q8TDQ0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HAVCR2Q8TDQ0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HAVCR2Q8TDQ0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HAVCR2Q8TDQ0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HAVCR2Q8TDQ0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HAVCR2Q8TDQ0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HAVCR2Q8TDQ0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HAVCR2Q8TDQ0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HAVCR2Q8TDQ0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HAVCR2Q8TDQ0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HAVCR2Q8TDQ0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HAVCR2Q8TDQ0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HAVCR2Q8TDQ0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HAVCR2Q8TDQ0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HAVCR2Q8TDQ0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HAVCR2Q8TDQ0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HAVCR2Q8TDQ0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HAVCR2Q8TDQ0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HAVCR2Q8TDQ0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HAVCR2Q8TDQ0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HAVCR2Q8TDQ0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HAVCR2Q8TDQ0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms