Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
DDX54Q8TDD1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
DDX54Q8TDD1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
DDX54Q8TDD1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
DDX54Q8TDD1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
DDX54Q8TDD1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
DDX54Q8TDD1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
DDX54Q8TDD1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
DDX54Q8TDD1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
DDX54Q8TDD1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
DDX54Q8TDD1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
DDX54Q8TDD1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
DDX54Q8TDD1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
DDX54Q8TDD1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC34.53■■■■□ 3.12
DDX54Q8TDD1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
DDX54Q8TDD1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
DDX54Q8TDD1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
DDX54Q8TDD1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
DDX54Q8TDD1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
DDX54Q8TDD1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
DDX54Q8TDD1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
DDX54Q8TDD1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
DDX54Q8TDD1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC34.5■■■■□ 3.11
DDX54Q8TDD1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
DDX54Q8TDD1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
DDX54Q8TDD1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
DDX54Q8TDD1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
DDX54Q8TDD1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
DDX54Q8TDD1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
DDX54Q8TDD1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
DDX54Q8TDD1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
DDX54Q8TDD1 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
DDX54Q8TDD1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
DDX54Q8TDD1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
DDX54Q8TDD1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
DDX54Q8TDD1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
DDX54Q8TDD1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
DDX54Q8TDD1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
DDX54Q8TDD1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC34.43■■■■□ 3.1
DDX54Q8TDD1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC34.41■■■■□ 3.1
DDX54Q8TDD1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
DDX54Q8TDD1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
DDX54Q8TDD1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC34.4■■■■□ 3.1
DDX54Q8TDD1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
DDX54Q8TDD1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
DDX54Q8TDD1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
DDX54Q8TDD1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
DDX54Q8TDD1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC34.38■■■■□ 3.09
DDX54Q8TDD1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
DDX54Q8TDD1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
DDX54Q8TDD1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
DDX54Q8TDD1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
DDX54Q8TDD1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
DDX54Q8TDD1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
DDX54Q8TDD1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
DDX54Q8TDD1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
DDX54Q8TDD1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
DDX54Q8TDD1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
DDX54Q8TDD1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
DDX54Q8TDD1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
DDX54Q8TDD1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
DDX54Q8TDD1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
DDX54Q8TDD1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
DDX54Q8TDD1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
DDX54Q8TDD1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
DDX54Q8TDD1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
DDX54Q8TDD1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
DDX54Q8TDD1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
DDX54Q8TDD1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
DDX54Q8TDD1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
DDX54Q8TDD1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
DDX54Q8TDD1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
DDX54Q8TDD1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
DDX54Q8TDD1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
DDX54Q8TDD1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
DDX54Q8TDD1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
DDX54Q8TDD1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
DDX54Q8TDD1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
DDX54Q8TDD1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
DDX54Q8TDD1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
DDX54Q8TDD1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
DDX54Q8TDD1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
DDX54Q8TDD1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
DDX54Q8TDD1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
DDX54Q8TDD1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
DDX54Q8TDD1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
DDX54Q8TDD1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
DDX54Q8TDD1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
DDX54Q8TDD1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
DDX54Q8TDD1 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
DDX54Q8TDD1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
DDX54Q8TDD1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
DDX54Q8TDD1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
DDX54Q8TDD1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
DDX54Q8TDD1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
DDX54Q8TDD1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
DDX54Q8TDD1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
DDX54Q8TDD1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
DDX54Q8TDD1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
DDX54Q8TDD1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms