Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC90

CCER1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER1Q8TC90 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
CCER1Q8TC90 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
CCER1Q8TC90 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
CCER1Q8TC90 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
CCER1Q8TC90 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC38.54■■■■□ 3.76
CCER1Q8TC90 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
CCER1Q8TC90 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
CCER1Q8TC90 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
CCER1Q8TC90 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
CCER1Q8TC90 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
CCER1Q8TC90 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC38.52■■■■□ 3.76
CCER1Q8TC90 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
CCER1Q8TC90 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
CCER1Q8TC90 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC38.52■■■■□ 3.76
CCER1Q8TC90 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
CCER1Q8TC90 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
CCER1Q8TC90 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
CCER1Q8TC90 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
CCER1Q8TC90 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
CCER1Q8TC90 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
CCER1Q8TC90 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
CCER1Q8TC90 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC38.49■■■■□ 3.75
CCER1Q8TC90 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.49■■■■□ 3.75
CCER1Q8TC90 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
CCER1Q8TC90 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
CCER1Q8TC90 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC38.48■■■■□ 3.75
CCER1Q8TC90 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
CCER1Q8TC90 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.45■■■■□ 3.75
CCER1Q8TC90 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC38.45■■■■□ 3.75
CCER1Q8TC90 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
CCER1Q8TC90 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.44■■■■□ 3.74
CCER1Q8TC90 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
CCER1Q8TC90 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
CCER1Q8TC90 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
CCER1Q8TC90 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
CCER1Q8TC90 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
CCER1Q8TC90 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
CCER1Q8TC90 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC38.42■■■■□ 3.74
CCER1Q8TC90 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.41■■■■□ 3.74
CCER1Q8TC90 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
CCER1Q8TC90 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC38.4■■■■□ 3.74
CCER1Q8TC90 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC38.4■■■■□ 3.74
CCER1Q8TC90 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
CCER1Q8TC90 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
CCER1Q8TC90 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC38.38■■■■□ 3.73
CCER1Q8TC90 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
CCER1Q8TC90 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC38.36■■■■□ 3.73
CCER1Q8TC90 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
CCER1Q8TC90 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
CCER1Q8TC90 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
CCER1Q8TC90 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
CCER1Q8TC90 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
CCER1Q8TC90 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
CCER1Q8TC90 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC38.34■■■■□ 3.73
CCER1Q8TC90 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
CCER1Q8TC90 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
CCER1Q8TC90 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
CCER1Q8TC90 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
CCER1Q8TC90 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
CCER1Q8TC90 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
CCER1Q8TC90 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
CCER1Q8TC90 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
CCER1Q8TC90 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC38.32■■■■□ 3.72
CCER1Q8TC90 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
CCER1Q8TC90 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
CCER1Q8TC90 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
CCER1Q8TC90 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
CCER1Q8TC90 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
CCER1Q8TC90 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
CCER1Q8TC90 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
CCER1Q8TC90 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC38.28■■■■□ 3.72
CCER1Q8TC90 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
CCER1Q8TC90 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
CCER1Q8TC90 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.26■■■■□ 3.72
CCER1Q8TC90 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.71
CCER1Q8TC90 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
CCER1Q8TC90 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
CCER1Q8TC90 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
CCER1Q8TC90 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
CCER1Q8TC90 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC38.24■■■■□ 3.71
CCER1Q8TC90 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
CCER1Q8TC90 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
CCER1Q8TC90 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
CCER1Q8TC90 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
CCER1Q8TC90 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
CCER1Q8TC90 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
CCER1Q8TC90 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
CCER1Q8TC90 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
CCER1Q8TC90 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
CCER1Q8TC90 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
CCER1Q8TC90 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.7
CCER1Q8TC90 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC38.19■■■■□ 3.7
CCER1Q8TC90 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
CCER1Q8TC90 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.19■■■■□ 3.7
CCER1Q8TC90 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC38.18■■■■□ 3.7
CCER1Q8TC90 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.18■■■■□ 3.7
CCER1Q8TC90 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
CCER1Q8TC90 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC38.17■■■■□ 3.7
CCER1Q8TC90 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
CCER1Q8TC90 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms