Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE3

FNDC9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC9Q8TBE3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FNDC9Q8TBE3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FNDC9Q8TBE3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FNDC9Q8TBE3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FNDC9Q8TBE3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FNDC9Q8TBE3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FNDC9Q8TBE3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FNDC9Q8TBE3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FNDC9Q8TBE3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FNDC9Q8TBE3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FNDC9Q8TBE3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FNDC9Q8TBE3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FNDC9Q8TBE3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FNDC9Q8TBE3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FNDC9Q8TBE3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FNDC9Q8TBE3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
FNDC9Q8TBE3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
FNDC9Q8TBE3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
FNDC9Q8TBE3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FNDC9Q8TBE3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FNDC9Q8TBE3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FNDC9Q8TBE3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FNDC9Q8TBE3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FNDC9Q8TBE3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FNDC9Q8TBE3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FNDC9Q8TBE3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FNDC9Q8TBE3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FNDC9Q8TBE3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FNDC9Q8TBE3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FNDC9Q8TBE3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FNDC9Q8TBE3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FNDC9Q8TBE3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FNDC9Q8TBE3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FNDC9Q8TBE3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FNDC9Q8TBE3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
FNDC9Q8TBE3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
FNDC9Q8TBE3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
FNDC9Q8TBE3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FNDC9Q8TBE3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FNDC9Q8TBE3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FNDC9Q8TBE3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FNDC9Q8TBE3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FNDC9Q8TBE3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FNDC9Q8TBE3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
FNDC9Q8TBE3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FNDC9Q8TBE3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FNDC9Q8TBE3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FNDC9Q8TBE3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FNDC9Q8TBE3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
FNDC9Q8TBE3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FNDC9Q8TBE3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FNDC9Q8TBE3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FNDC9Q8TBE3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FNDC9Q8TBE3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FNDC9Q8TBE3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FNDC9Q8TBE3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FNDC9Q8TBE3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FNDC9Q8TBE3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FNDC9Q8TBE3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FNDC9Q8TBE3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FNDC9Q8TBE3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FNDC9Q8TBE3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FNDC9Q8TBE3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FNDC9Q8TBE3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FNDC9Q8TBE3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FNDC9Q8TBE3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FNDC9Q8TBE3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FNDC9Q8TBE3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FNDC9Q8TBE3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FNDC9Q8TBE3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FNDC9Q8TBE3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FNDC9Q8TBE3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FNDC9Q8TBE3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FNDC9Q8TBE3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
FNDC9Q8TBE3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FNDC9Q8TBE3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
FNDC9Q8TBE3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
FNDC9Q8TBE3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FNDC9Q8TBE3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FNDC9Q8TBE3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FNDC9Q8TBE3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FNDC9Q8TBE3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FNDC9Q8TBE3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FNDC9Q8TBE3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
FNDC9Q8TBE3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
FNDC9Q8TBE3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
FNDC9Q8TBE3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
FNDC9Q8TBE3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
FNDC9Q8TBE3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
FNDC9Q8TBE3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
FNDC9Q8TBE3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
FNDC9Q8TBE3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
FNDC9Q8TBE3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
FNDC9Q8TBE3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FNDC9Q8TBE3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FNDC9Q8TBE3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FNDC9Q8TBE3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
FNDC9Q8TBE3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FNDC9Q8TBE3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FNDC9Q8TBE3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms