Protein–RNA interactions for Protein: Q8TB24

RIN3, Ras and Rab interactor 3, humanhuman

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIN3Q8TB24 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
RIN3Q8TB24 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
RIN3Q8TB24 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
RIN3Q8TB24 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
RIN3Q8TB24 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
RIN3Q8TB24 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
RIN3Q8TB24 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
RIN3Q8TB24 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
RIN3Q8TB24 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
RIN3Q8TB24 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RIN3Q8TB24 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RIN3Q8TB24 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RIN3Q8TB24 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RIN3Q8TB24 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RIN3Q8TB24 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RIN3Q8TB24 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RIN3Q8TB24 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RIN3Q8TB24 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RIN3Q8TB24 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RIN3Q8TB24 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RIN3Q8TB24 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RIN3Q8TB24 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RIN3Q8TB24 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RIN3Q8TB24 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RIN3Q8TB24 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RIN3Q8TB24 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RIN3Q8TB24 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RIN3Q8TB24 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RIN3Q8TB24 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RIN3Q8TB24 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RIN3Q8TB24 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RIN3Q8TB24 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RIN3Q8TB24 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RIN3Q8TB24 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RIN3Q8TB24 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
RIN3Q8TB24 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RIN3Q8TB24 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RIN3Q8TB24 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RIN3Q8TB24 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RIN3Q8TB24 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RIN3Q8TB24 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RIN3Q8TB24 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
RIN3Q8TB24 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RIN3Q8TB24 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RIN3Q8TB24 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RIN3Q8TB24 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
RIN3Q8TB24 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RIN3Q8TB24 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RIN3Q8TB24 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RIN3Q8TB24 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RIN3Q8TB24 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RIN3Q8TB24 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RIN3Q8TB24 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
RIN3Q8TB24 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
RIN3Q8TB24 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RIN3Q8TB24 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RIN3Q8TB24 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RIN3Q8TB24 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RIN3Q8TB24 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RIN3Q8TB24 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RIN3Q8TB24 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RIN3Q8TB24 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RIN3Q8TB24 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RIN3Q8TB24 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RIN3Q8TB24 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RIN3Q8TB24 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RIN3Q8TB24 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
RIN3Q8TB24 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RIN3Q8TB24 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
RIN3Q8TB24 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RIN3Q8TB24 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
RIN3Q8TB24 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RIN3Q8TB24 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RIN3Q8TB24 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RIN3Q8TB24 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RIN3Q8TB24 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RIN3Q8TB24 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RIN3Q8TB24 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RIN3Q8TB24 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RIN3Q8TB24 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RIN3Q8TB24 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RIN3Q8TB24 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RIN3Q8TB24 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
RIN3Q8TB24 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RIN3Q8TB24 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RIN3Q8TB24 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RIN3Q8TB24 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RIN3Q8TB24 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RIN3Q8TB24 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RIN3Q8TB24 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RIN3Q8TB24 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RIN3Q8TB24 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RIN3Q8TB24 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
RIN3Q8TB24 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RIN3Q8TB24 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RIN3Q8TB24 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RIN3Q8TB24 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RIN3Q8TB24 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
RIN3Q8TB24 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RIN3Q8TB24 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms