Protein–RNA interactions for Protein: Q8NI22

MCFD2, Multiple coagulation factor deficiency protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCFD2Q8NI22 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCFD2Q8NI22 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCFD2Q8NI22 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCFD2Q8NI22 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCFD2Q8NI22 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCFD2Q8NI22 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCFD2Q8NI22 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCFD2Q8NI22 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCFD2Q8NI22 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCFD2Q8NI22 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCFD2Q8NI22 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCFD2Q8NI22 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCFD2Q8NI22 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCFD2Q8NI22 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCFD2Q8NI22 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCFD2Q8NI22 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MCFD2Q8NI22 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCFD2Q8NI22 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCFD2Q8NI22 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCFD2Q8NI22 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCFD2Q8NI22 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCFD2Q8NI22 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCFD2Q8NI22 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCFD2Q8NI22 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCFD2Q8NI22 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCFD2Q8NI22 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCFD2Q8NI22 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCFD2Q8NI22 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MCFD2Q8NI22 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MCFD2Q8NI22 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MCFD2Q8NI22 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MCFD2Q8NI22 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MCFD2Q8NI22 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MCFD2Q8NI22 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCFD2Q8NI22 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCFD2Q8NI22 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCFD2Q8NI22 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MCFD2Q8NI22 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
MCFD2Q8NI22 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MCFD2Q8NI22 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MCFD2Q8NI22 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MCFD2Q8NI22 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
MCFD2Q8NI22 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCFD2Q8NI22 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCFD2Q8NI22 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCFD2Q8NI22 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCFD2Q8NI22 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCFD2Q8NI22 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCFD2Q8NI22 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCFD2Q8NI22 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MCFD2Q8NI22 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCFD2Q8NI22 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCFD2Q8NI22 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCFD2Q8NI22 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCFD2Q8NI22 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCFD2Q8NI22 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCFD2Q8NI22 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCFD2Q8NI22 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCFD2Q8NI22 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCFD2Q8NI22 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCFD2Q8NI22 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCFD2Q8NI22 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCFD2Q8NI22 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCFD2Q8NI22 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCFD2Q8NI22 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCFD2Q8NI22 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCFD2Q8NI22 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCFD2Q8NI22 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCFD2Q8NI22 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCFD2Q8NI22 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCFD2Q8NI22 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCFD2Q8NI22 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCFD2Q8NI22 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCFD2Q8NI22 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCFD2Q8NI22 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCFD2Q8NI22 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCFD2Q8NI22 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCFD2Q8NI22 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCFD2Q8NI22 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCFD2Q8NI22 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MCFD2Q8NI22 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MCFD2Q8NI22 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MCFD2Q8NI22 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCFD2Q8NI22 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCFD2Q8NI22 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCFD2Q8NI22 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCFD2Q8NI22 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCFD2Q8NI22 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCFD2Q8NI22 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCFD2Q8NI22 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCFD2Q8NI22 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCFD2Q8NI22 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCFD2Q8NI22 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCFD2Q8NI22 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCFD2Q8NI22 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCFD2Q8NI22 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCFD2Q8NI22 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCFD2Q8NI22 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCFD2Q8NI22 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCFD2Q8NI22 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms