Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSNK2A3Q8NEV1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSNK2A3Q8NEV1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSNK2A3Q8NEV1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSNK2A3Q8NEV1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSNK2A3Q8NEV1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CSNK2A3Q8NEV1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CSNK2A3Q8NEV1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSNK2A3Q8NEV1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSNK2A3Q8NEV1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSNK2A3Q8NEV1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSNK2A3Q8NEV1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSNK2A3Q8NEV1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSNK2A3Q8NEV1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CSNK2A3Q8NEV1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSNK2A3Q8NEV1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSNK2A3Q8NEV1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSNK2A3Q8NEV1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSNK2A3Q8NEV1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSNK2A3Q8NEV1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSNK2A3Q8NEV1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSNK2A3Q8NEV1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSNK2A3Q8NEV1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSNK2A3Q8NEV1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSNK2A3Q8NEV1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSNK2A3Q8NEV1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSNK2A3Q8NEV1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSNK2A3Q8NEV1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSNK2A3Q8NEV1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSNK2A3Q8NEV1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSNK2A3Q8NEV1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSNK2A3Q8NEV1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSNK2A3Q8NEV1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CSNK2A3Q8NEV1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CSNK2A3Q8NEV1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSNK2A3Q8NEV1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CSNK2A3Q8NEV1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSNK2A3Q8NEV1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSNK2A3Q8NEV1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSNK2A3Q8NEV1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSNK2A3Q8NEV1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSNK2A3Q8NEV1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSNK2A3Q8NEV1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSNK2A3Q8NEV1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSNK2A3Q8NEV1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSNK2A3Q8NEV1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSNK2A3Q8NEV1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSNK2A3Q8NEV1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSNK2A3Q8NEV1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSNK2A3Q8NEV1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSNK2A3Q8NEV1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSNK2A3Q8NEV1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CSNK2A3Q8NEV1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSNK2A3Q8NEV1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSNK2A3Q8NEV1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSNK2A3Q8NEV1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CSNK2A3Q8NEV1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CSNK2A3Q8NEV1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSNK2A3Q8NEV1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSNK2A3Q8NEV1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSNK2A3Q8NEV1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CSNK2A3Q8NEV1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CSNK2A3Q8NEV1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSNK2A3Q8NEV1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSNK2A3Q8NEV1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSNK2A3Q8NEV1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSNK2A3Q8NEV1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSNK2A3Q8NEV1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSNK2A3Q8NEV1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSNK2A3Q8NEV1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSNK2A3Q8NEV1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CSNK2A3Q8NEV1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSNK2A3Q8NEV1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSNK2A3Q8NEV1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSNK2A3Q8NEV1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSNK2A3Q8NEV1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSNK2A3Q8NEV1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSNK2A3Q8NEV1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSNK2A3Q8NEV1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSNK2A3Q8NEV1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSNK2A3Q8NEV1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSNK2A3Q8NEV1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSNK2A3Q8NEV1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSNK2A3Q8NEV1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSNK2A3Q8NEV1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSNK2A3Q8NEV1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSNK2A3Q8NEV1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSNK2A3Q8NEV1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSNK2A3Q8NEV1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSNK2A3Q8NEV1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSNK2A3Q8NEV1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSNK2A3Q8NEV1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSNK2A3Q8NEV1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSNK2A3Q8NEV1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSNK2A3Q8NEV1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSNK2A3Q8NEV1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSNK2A3Q8NEV1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSNK2A3Q8NEV1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms