Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP4

C17orf47, Uncharacterized protein C17orf47, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf47Q8NEP4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C17orf47Q8NEP4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C17orf47Q8NEP4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C17orf47Q8NEP4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C17orf47Q8NEP4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C17orf47Q8NEP4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C17orf47Q8NEP4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C17orf47Q8NEP4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C17orf47Q8NEP4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
C17orf47Q8NEP4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
C17orf47Q8NEP4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
C17orf47Q8NEP4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C17orf47Q8NEP4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C17orf47Q8NEP4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C17orf47Q8NEP4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
C17orf47Q8NEP4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
C17orf47Q8NEP4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C17orf47Q8NEP4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C17orf47Q8NEP4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C17orf47Q8NEP4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C17orf47Q8NEP4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C17orf47Q8NEP4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C17orf47Q8NEP4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
C17orf47Q8NEP4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C17orf47Q8NEP4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C17orf47Q8NEP4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C17orf47Q8NEP4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C17orf47Q8NEP4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C17orf47Q8NEP4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C17orf47Q8NEP4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C17orf47Q8NEP4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C17orf47Q8NEP4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C17orf47Q8NEP4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C17orf47Q8NEP4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C17orf47Q8NEP4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C17orf47Q8NEP4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C17orf47Q8NEP4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C17orf47Q8NEP4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
C17orf47Q8NEP4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
C17orf47Q8NEP4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C17orf47Q8NEP4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C17orf47Q8NEP4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C17orf47Q8NEP4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C17orf47Q8NEP4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C17orf47Q8NEP4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C17orf47Q8NEP4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C17orf47Q8NEP4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C17orf47Q8NEP4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C17orf47Q8NEP4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C17orf47Q8NEP4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
C17orf47Q8NEP4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C17orf47Q8NEP4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C17orf47Q8NEP4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C17orf47Q8NEP4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C17orf47Q8NEP4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C17orf47Q8NEP4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C17orf47Q8NEP4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C17orf47Q8NEP4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C17orf47Q8NEP4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
C17orf47Q8NEP4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
C17orf47Q8NEP4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C17orf47Q8NEP4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C17orf47Q8NEP4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
C17orf47Q8NEP4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C17orf47Q8NEP4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
C17orf47Q8NEP4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
C17orf47Q8NEP4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C17orf47Q8NEP4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C17orf47Q8NEP4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C17orf47Q8NEP4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C17orf47Q8NEP4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C17orf47Q8NEP4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C17orf47Q8NEP4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C17orf47Q8NEP4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C17orf47Q8NEP4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C17orf47Q8NEP4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C17orf47Q8NEP4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
C17orf47Q8NEP4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C17orf47Q8NEP4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C17orf47Q8NEP4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C17orf47Q8NEP4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C17orf47Q8NEP4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C17orf47Q8NEP4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C17orf47Q8NEP4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C17orf47Q8NEP4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C17orf47Q8NEP4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C17orf47Q8NEP4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C17orf47Q8NEP4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C17orf47Q8NEP4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C17orf47Q8NEP4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
C17orf47Q8NEP4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
C17orf47Q8NEP4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C17orf47Q8NEP4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C17orf47Q8NEP4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
C17orf47Q8NEP4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C17orf47Q8NEP4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
C17orf47Q8NEP4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
C17orf47Q8NEP4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C17orf47Q8NEP4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C17orf47Q8NEP4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms