Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CARMIL3Q8ND23 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
CARMIL3Q8ND23 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
CARMIL3Q8ND23 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CARMIL3Q8ND23 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CARMIL3Q8ND23 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
CARMIL3Q8ND23 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CARMIL3Q8ND23 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CARMIL3Q8ND23 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CARMIL3Q8ND23 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CARMIL3Q8ND23 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CARMIL3Q8ND23 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CARMIL3Q8ND23 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CARMIL3Q8ND23 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CARMIL3Q8ND23 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CARMIL3Q8ND23 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CARMIL3Q8ND23 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CARMIL3Q8ND23 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
CARMIL3Q8ND23 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC33.01■■■□□ 2.88
CARMIL3Q8ND23 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.88
CARMIL3Q8ND23 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
CARMIL3Q8ND23 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
CARMIL3Q8ND23 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CARMIL3Q8ND23 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
CARMIL3Q8ND23 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
CARMIL3Q8ND23 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
CARMIL3Q8ND23 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
CARMIL3Q8ND23 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CARMIL3Q8ND23 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CARMIL3Q8ND23 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
CARMIL3Q8ND23 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
CARMIL3Q8ND23 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
CARMIL3Q8ND23 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC32.96■■■□□ 2.87
CARMIL3Q8ND23 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
CARMIL3Q8ND23 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
CARMIL3Q8ND23 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC32.96■■■□□ 2.87
CARMIL3Q8ND23 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
CARMIL3Q8ND23 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC32.95■■■□□ 2.86
CARMIL3Q8ND23 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CARMIL3Q8ND23 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CARMIL3Q8ND23 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
CARMIL3Q8ND23 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
CARMIL3Q8ND23 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CARMIL3Q8ND23 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
CARMIL3Q8ND23 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CARMIL3Q8ND23 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CARMIL3Q8ND23 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CARMIL3Q8ND23 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CARMIL3Q8ND23 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
CARMIL3Q8ND23 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
CARMIL3Q8ND23 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CARMIL3Q8ND23 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
CARMIL3Q8ND23 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CARMIL3Q8ND23 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CARMIL3Q8ND23 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CARMIL3Q8ND23 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CARMIL3Q8ND23 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CARMIL3Q8ND23 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
CARMIL3Q8ND23 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
CARMIL3Q8ND23 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
CARMIL3Q8ND23 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
CARMIL3Q8ND23 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CARMIL3Q8ND23 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
CARMIL3Q8ND23 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
CARMIL3Q8ND23 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
CARMIL3Q8ND23 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CARMIL3Q8ND23 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC32.79■■■□□ 2.84
CARMIL3Q8ND23 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CARMIL3Q8ND23 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CARMIL3Q8ND23 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CARMIL3Q8ND23 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CARMIL3Q8ND23 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
CARMIL3Q8ND23 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
CARMIL3Q8ND23 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
CARMIL3Q8ND23 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CARMIL3Q8ND23 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CARMIL3Q8ND23 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CARMIL3Q8ND23 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CARMIL3Q8ND23 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CARMIL3Q8ND23 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CARMIL3Q8ND23 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CARMIL3Q8ND23 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CARMIL3Q8ND23 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CARMIL3Q8ND23 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CARMIL3Q8ND23 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CARMIL3Q8ND23 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CARMIL3Q8ND23 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CARMIL3Q8ND23 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CARMIL3Q8ND23 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CARMIL3Q8ND23 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
CARMIL3Q8ND23 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
CARMIL3Q8ND23 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
CARMIL3Q8ND23 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CARMIL3Q8ND23 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CARMIL3Q8ND23 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
CARMIL3Q8ND23 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CARMIL3Q8ND23 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
CARMIL3Q8ND23 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CARMIL3Q8ND23 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CARMIL3Q8ND23 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms