Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8U9

BMPER, BMP-binding endothelial regulator protein, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMPERQ8N8U9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BMPERQ8N8U9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BMPERQ8N8U9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
BMPERQ8N8U9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BMPERQ8N8U9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BMPERQ8N8U9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
BMPERQ8N8U9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BMPERQ8N8U9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BMPERQ8N8U9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BMPERQ8N8U9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BMPERQ8N8U9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
BMPERQ8N8U9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BMPERQ8N8U9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BMPERQ8N8U9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BMPERQ8N8U9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BMPERQ8N8U9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BMPERQ8N8U9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BMPERQ8N8U9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BMPERQ8N8U9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
BMPERQ8N8U9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BMPERQ8N8U9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BMPERQ8N8U9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BMPERQ8N8U9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BMPERQ8N8U9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BMPERQ8N8U9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BMPERQ8N8U9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BMPERQ8N8U9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BMPERQ8N8U9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BMPERQ8N8U9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BMPERQ8N8U9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BMPERQ8N8U9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BMPERQ8N8U9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BMPERQ8N8U9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BMPERQ8N8U9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BMPERQ8N8U9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BMPERQ8N8U9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
BMPERQ8N8U9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BMPERQ8N8U9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BMPERQ8N8U9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BMPERQ8N8U9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BMPERQ8N8U9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BMPERQ8N8U9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BMPERQ8N8U9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BMPERQ8N8U9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
BMPERQ8N8U9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BMPERQ8N8U9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BMPERQ8N8U9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BMPERQ8N8U9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BMPERQ8N8U9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BMPERQ8N8U9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BMPERQ8N8U9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BMPERQ8N8U9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BMPERQ8N8U9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BMPERQ8N8U9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BMPERQ8N8U9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BMPERQ8N8U9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BMPERQ8N8U9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BMPERQ8N8U9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BMPERQ8N8U9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BMPERQ8N8U9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BMPERQ8N8U9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BMPERQ8N8U9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BMPERQ8N8U9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BMPERQ8N8U9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BMPERQ8N8U9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BMPERQ8N8U9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BMPERQ8N8U9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BMPERQ8N8U9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BMPERQ8N8U9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BMPERQ8N8U9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BMPERQ8N8U9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BMPERQ8N8U9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BMPERQ8N8U9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BMPERQ8N8U9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BMPERQ8N8U9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BMPERQ8N8U9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BMPERQ8N8U9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BMPERQ8N8U9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BMPERQ8N8U9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BMPERQ8N8U9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BMPERQ8N8U9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BMPERQ8N8U9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BMPERQ8N8U9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BMPERQ8N8U9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
BMPERQ8N8U9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BMPERQ8N8U9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BMPERQ8N8U9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BMPERQ8N8U9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BMPERQ8N8U9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BMPERQ8N8U9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BMPERQ8N8U9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
BMPERQ8N8U9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
BMPERQ8N8U9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BMPERQ8N8U9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BMPERQ8N8U9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BMPERQ8N8U9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BMPERQ8N8U9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BMPERQ8N8U9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BMPERQ8N8U9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
BMPERQ8N8U9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms