Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F7

GCSAM, Germinal center-associated signaling and motility protein, humanhuman

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Length 178 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSAMQ8N6F7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GCSAMQ8N6F7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCSAMQ8N6F7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCSAMQ8N6F7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCSAMQ8N6F7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCSAMQ8N6F7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GCSAMQ8N6F7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GCSAMQ8N6F7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GCSAMQ8N6F7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GCSAMQ8N6F7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GCSAMQ8N6F7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GCSAMQ8N6F7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GCSAMQ8N6F7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GCSAMQ8N6F7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GCSAMQ8N6F7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GCSAMQ8N6F7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GCSAMQ8N6F7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GCSAMQ8N6F7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GCSAMQ8N6F7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GCSAMQ8N6F7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GCSAMQ8N6F7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GCSAMQ8N6F7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GCSAMQ8N6F7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GCSAMQ8N6F7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GCSAMQ8N6F7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GCSAMQ8N6F7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GCSAMQ8N6F7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GCSAMQ8N6F7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GCSAMQ8N6F7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GCSAMQ8N6F7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GCSAMQ8N6F7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GCSAMQ8N6F7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GCSAMQ8N6F7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GCSAMQ8N6F7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GCSAMQ8N6F7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GCSAMQ8N6F7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GCSAMQ8N6F7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GCSAMQ8N6F7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GCSAMQ8N6F7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GCSAMQ8N6F7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GCSAMQ8N6F7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GCSAMQ8N6F7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GCSAMQ8N6F7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GCSAMQ8N6F7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GCSAMQ8N6F7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GCSAMQ8N6F7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GCSAMQ8N6F7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GCSAMQ8N6F7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GCSAMQ8N6F7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
GCSAMQ8N6F7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GCSAMQ8N6F7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GCSAMQ8N6F7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GCSAMQ8N6F7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GCSAMQ8N6F7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GCSAMQ8N6F7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GCSAMQ8N6F7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GCSAMQ8N6F7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GCSAMQ8N6F7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GCSAMQ8N6F7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GCSAMQ8N6F7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GCSAMQ8N6F7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GCSAMQ8N6F7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GCSAMQ8N6F7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GCSAMQ8N6F7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GCSAMQ8N6F7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GCSAMQ8N6F7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GCSAMQ8N6F7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GCSAMQ8N6F7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GCSAMQ8N6F7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GCSAMQ8N6F7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GCSAMQ8N6F7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GCSAMQ8N6F7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GCSAMQ8N6F7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GCSAMQ8N6F7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GCSAMQ8N6F7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GCSAMQ8N6F7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GCSAMQ8N6F7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GCSAMQ8N6F7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GCSAMQ8N6F7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GCSAMQ8N6F7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GCSAMQ8N6F7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GCSAMQ8N6F7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GCSAMQ8N6F7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GCSAMQ8N6F7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GCSAMQ8N6F7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GCSAMQ8N6F7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GCSAMQ8N6F7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GCSAMQ8N6F7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GCSAMQ8N6F7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GCSAMQ8N6F7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GCSAMQ8N6F7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GCSAMQ8N6F7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GCSAMQ8N6F7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GCSAMQ8N6F7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
GCSAMQ8N6F7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GCSAMQ8N6F7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GCSAMQ8N6F7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GCSAMQ8N6F7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GCSAMQ8N6F7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GCSAMQ8N6F7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
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