Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5J4

SPIC, Transcription factor Spi-C, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPICQ8N5J4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPICQ8N5J4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPICQ8N5J4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPICQ8N5J4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPICQ8N5J4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPICQ8N5J4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SPICQ8N5J4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPICQ8N5J4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPICQ8N5J4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPICQ8N5J4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPICQ8N5J4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPICQ8N5J4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPICQ8N5J4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPICQ8N5J4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPICQ8N5J4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPICQ8N5J4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPICQ8N5J4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SPICQ8N5J4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPICQ8N5J4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPICQ8N5J4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPICQ8N5J4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SPICQ8N5J4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPICQ8N5J4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPICQ8N5J4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPICQ8N5J4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPICQ8N5J4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPICQ8N5J4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPICQ8N5J4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPICQ8N5J4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPICQ8N5J4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPICQ8N5J4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPICQ8N5J4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPICQ8N5J4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPICQ8N5J4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPICQ8N5J4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPICQ8N5J4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPICQ8N5J4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPICQ8N5J4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPICQ8N5J4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPICQ8N5J4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPICQ8N5J4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPICQ8N5J4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPICQ8N5J4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPICQ8N5J4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPICQ8N5J4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPICQ8N5J4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPICQ8N5J4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPICQ8N5J4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPICQ8N5J4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPICQ8N5J4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPICQ8N5J4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPICQ8N5J4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPICQ8N5J4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPICQ8N5J4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPICQ8N5J4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPICQ8N5J4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPICQ8N5J4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPICQ8N5J4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPICQ8N5J4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPICQ8N5J4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPICQ8N5J4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPICQ8N5J4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPICQ8N5J4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPICQ8N5J4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPICQ8N5J4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPICQ8N5J4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPICQ8N5J4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPICQ8N5J4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPICQ8N5J4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPICQ8N5J4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPICQ8N5J4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPICQ8N5J4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPICQ8N5J4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPICQ8N5J4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPICQ8N5J4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPICQ8N5J4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPICQ8N5J4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPICQ8N5J4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPICQ8N5J4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPICQ8N5J4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPICQ8N5J4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPICQ8N5J4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPICQ8N5J4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPICQ8N5J4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPICQ8N5J4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPICQ8N5J4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPICQ8N5J4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SPICQ8N5J4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPICQ8N5J4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPICQ8N5J4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPICQ8N5J4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPICQ8N5J4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPICQ8N5J4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPICQ8N5J4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPICQ8N5J4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPICQ8N5J4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPICQ8N5J4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPICQ8N5J4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPICQ8N5J4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPICQ8N5J4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 177.4 ms