Protein–RNA interactions for Protein: Q8N535

LINC00471, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00471, humanhuman

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00471Q8N535 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LINC00471Q8N535 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LINC00471Q8N535 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LINC00471Q8N535 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LINC00471Q8N535 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LINC00471Q8N535 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LINC00471Q8N535 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LINC00471Q8N535 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LINC00471Q8N535 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LINC00471Q8N535 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LINC00471Q8N535 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
LINC00471Q8N535 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LINC00471Q8N535 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LINC00471Q8N535 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LINC00471Q8N535 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LINC00471Q8N535 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LINC00471Q8N535 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LINC00471Q8N535 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LINC00471Q8N535 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LINC00471Q8N535 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LINC00471Q8N535 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LINC00471Q8N535 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LINC00471Q8N535 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LINC00471Q8N535 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LINC00471Q8N535 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LINC00471Q8N535 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LINC00471Q8N535 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LINC00471Q8N535 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LINC00471Q8N535 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LINC00471Q8N535 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LINC00471Q8N535 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC00471Q8N535 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC00471Q8N535 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC00471Q8N535 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC00471Q8N535 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC00471Q8N535 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC00471Q8N535 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC00471Q8N535 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LINC00471Q8N535 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC00471Q8N535 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC00471Q8N535 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LINC00471Q8N535 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LINC00471Q8N535 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LINC00471Q8N535 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LINC00471Q8N535 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LINC00471Q8N535 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LINC00471Q8N535 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LINC00471Q8N535 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LINC00471Q8N535 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LINC00471Q8N535 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LINC00471Q8N535 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LINC00471Q8N535 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LINC00471Q8N535 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LINC00471Q8N535 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LINC00471Q8N535 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LINC00471Q8N535 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LINC00471Q8N535 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LINC00471Q8N535 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LINC00471Q8N535 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LINC00471Q8N535 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LINC00471Q8N535 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LINC00471Q8N535 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LINC00471Q8N535 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LINC00471Q8N535 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LINC00471Q8N535 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LINC00471Q8N535 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LINC00471Q8N535 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LINC00471Q8N535 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LINC00471Q8N535 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC00471Q8N535 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC00471Q8N535 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC00471Q8N535 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC00471Q8N535 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC00471Q8N535 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC00471Q8N535 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC00471Q8N535 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC00471Q8N535 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC00471Q8N535 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINC00471Q8N535 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINC00471Q8N535 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINC00471Q8N535 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINC00471Q8N535 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINC00471Q8N535 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC00471Q8N535 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC00471Q8N535 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC00471Q8N535 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC00471Q8N535 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC00471Q8N535 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC00471Q8N535 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC00471Q8N535 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC00471Q8N535 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LINC00471Q8N535 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LINC00471Q8N535 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LINC00471Q8N535 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LINC00471Q8N535 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LINC00471Q8N535 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINC00471Q8N535 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINC00471Q8N535 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINC00471Q8N535 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINC00471Q8N535 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms