Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3P4

VPS8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS8Q8N3P4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
VPS8Q8N3P4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC41.21■■■■■ 4.19
VPS8Q8N3P4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
VPS8Q8N3P4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC41.19■■■■■ 4.18
VPS8Q8N3P4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC41.18■■■■■ 4.18
VPS8Q8N3P4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
VPS8Q8N3P4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
VPS8Q8N3P4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
VPS8Q8N3P4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.15■■■■■ 4.18
VPS8Q8N3P4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
VPS8Q8N3P4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.14■■■■■ 4.18
VPS8Q8N3P4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC41.13■■■■■ 4.17
VPS8Q8N3P4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.12■■■■■ 4.17
VPS8Q8N3P4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC41.12■■■■■ 4.17
VPS8Q8N3P4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
VPS8Q8N3P4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
VPS8Q8N3P4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.08■■■■■ 4.17
VPS8Q8N3P4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
VPS8Q8N3P4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC41.07■■■■■ 4.16
VPS8Q8N3P4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC41.06■■■■■ 4.16
VPS8Q8N3P4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
VPS8Q8N3P4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
VPS8Q8N3P4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
VPS8Q8N3P4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC41.03■■■■■ 4.16
VPS8Q8N3P4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC41.03■■■■■ 4.16
VPS8Q8N3P4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC41.03■■■■■ 4.16
VPS8Q8N3P4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.01■■■■■ 4.16
VPS8Q8N3P4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC41.01■■■■■ 4.16
VPS8Q8N3P4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC41.01■■■■■ 4.16
VPS8Q8N3P4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC41.01■■■■■ 4.16
VPS8Q8N3P4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41■■■■■ 4.15
VPS8Q8N3P4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
VPS8Q8N3P4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC40.99■■■■■ 4.15
VPS8Q8N3P4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC40.98■■■■■ 4.15
VPS8Q8N3P4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
VPS8Q8N3P4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.98■■■■■ 4.15
VPS8Q8N3P4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC40.98■■■■■ 4.15
VPS8Q8N3P4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC40.97■■■■■ 4.15
VPS8Q8N3P4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
VPS8Q8N3P4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC40.96■■■■■ 4.15
VPS8Q8N3P4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC40.96■■■■■ 4.15
VPS8Q8N3P4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
VPS8Q8N3P4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
VPS8Q8N3P4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC40.95■■■■■ 4.15
VPS8Q8N3P4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
VPS8Q8N3P4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
VPS8Q8N3P4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
VPS8Q8N3P4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
VPS8Q8N3P4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC40.91■■■■■ 4.14
VPS8Q8N3P4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.9■■■■■ 4.14
VPS8Q8N3P4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
VPS8Q8N3P4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
VPS8Q8N3P4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
VPS8Q8N3P4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC40.89■■■■■ 4.14
VPS8Q8N3P4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC40.89■■■■■ 4.14
VPS8Q8N3P4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
VPS8Q8N3P4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC40.88■■■■■ 4.14
VPS8Q8N3P4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC40.88■■■■■ 4.14
VPS8Q8N3P4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC40.88■■■■■ 4.13
VPS8Q8N3P4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
VPS8Q8N3P4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC40.88■■■■■ 4.13
VPS8Q8N3P4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.88■■■■■ 4.13
VPS8Q8N3P4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC40.87■■■■■ 4.13
VPS8Q8N3P4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC40.87■■■■■ 4.13
VPS8Q8N3P4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC40.87■■■■■ 4.13
VPS8Q8N3P4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC40.87■■■■■ 4.13
VPS8Q8N3P4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC40.87■■■■■ 4.13
VPS8Q8N3P4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC40.87■■■■■ 4.13
VPS8Q8N3P4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC40.87■■■■■ 4.13
VPS8Q8N3P4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC40.87■■■■■ 4.13
VPS8Q8N3P4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC40.87■■■■■ 4.13
VPS8Q8N3P4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
VPS8Q8N3P4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
VPS8Q8N3P4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
VPS8Q8N3P4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
VPS8Q8N3P4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC40.86■■■■■ 4.13
VPS8Q8N3P4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC40.86■■■■■ 4.13
VPS8Q8N3P4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC40.86■■■■■ 4.13
VPS8Q8N3P4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
VPS8Q8N3P4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.85■■■■■ 4.13
VPS8Q8N3P4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
VPS8Q8N3P4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC40.85■■■■■ 4.13
VPS8Q8N3P4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC40.85■■■■■ 4.13
VPS8Q8N3P4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
VPS8Q8N3P4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC40.84■■■■■ 4.13
VPS8Q8N3P4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.84■■■■■ 4.13
VPS8Q8N3P4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC40.84■■■■■ 4.13
VPS8Q8N3P4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC40.84■■■■■ 4.13
VPS8Q8N3P4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.83■■■■■ 4.13
VPS8Q8N3P4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
VPS8Q8N3P4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC40.82■■■■■ 4.12
VPS8Q8N3P4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC40.81■■■■■ 4.12
VPS8Q8N3P4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
VPS8Q8N3P4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC40.81■■■■■ 4.12
VPS8Q8N3P4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
VPS8Q8N3P4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
VPS8Q8N3P4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
VPS8Q8N3P4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.79■■■■■ 4.12
VPS8Q8N3P4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC40.79■■■■■ 4.12
VPS8Q8N3P4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC40.79■■■■■ 4.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms