Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3J3

C17orf53, Uncharacterized protein C17orf53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf53Q8N3J3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
C17orf53Q8N3J3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
C17orf53Q8N3J3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
C17orf53Q8N3J3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
C17orf53Q8N3J3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
C17orf53Q8N3J3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
C17orf53Q8N3J3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
C17orf53Q8N3J3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
C17orf53Q8N3J3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.13
C17orf53Q8N3J3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
C17orf53Q8N3J3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
C17orf53Q8N3J3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
C17orf53Q8N3J3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
C17orf53Q8N3J3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
C17orf53Q8N3J3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
C17orf53Q8N3J3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
C17orf53Q8N3J3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
C17orf53Q8N3J3 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
C17orf53Q8N3J3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
C17orf53Q8N3J3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
C17orf53Q8N3J3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
C17orf53Q8N3J3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
C17orf53Q8N3J3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
C17orf53Q8N3J3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
C17orf53Q8N3J3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
C17orf53Q8N3J3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
C17orf53Q8N3J3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
C17orf53Q8N3J3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
C17orf53Q8N3J3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
C17orf53Q8N3J3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
C17orf53Q8N3J3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
C17orf53Q8N3J3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
C17orf53Q8N3J3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
C17orf53Q8N3J3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
C17orf53Q8N3J3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
C17orf53Q8N3J3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
C17orf53Q8N3J3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
C17orf53Q8N3J3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
C17orf53Q8N3J3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
C17orf53Q8N3J3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
C17orf53Q8N3J3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
C17orf53Q8N3J3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
C17orf53Q8N3J3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
C17orf53Q8N3J3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
C17orf53Q8N3J3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
C17orf53Q8N3J3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
C17orf53Q8N3J3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
C17orf53Q8N3J3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
C17orf53Q8N3J3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
C17orf53Q8N3J3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
C17orf53Q8N3J3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
C17orf53Q8N3J3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
C17orf53Q8N3J3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
C17orf53Q8N3J3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
C17orf53Q8N3J3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
C17orf53Q8N3J3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
C17orf53Q8N3J3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
C17orf53Q8N3J3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
C17orf53Q8N3J3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
C17orf53Q8N3J3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
C17orf53Q8N3J3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
C17orf53Q8N3J3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
C17orf53Q8N3J3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
C17orf53Q8N3J3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
C17orf53Q8N3J3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
C17orf53Q8N3J3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
C17orf53Q8N3J3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
C17orf53Q8N3J3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
C17orf53Q8N3J3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
C17orf53Q8N3J3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
C17orf53Q8N3J3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
C17orf53Q8N3J3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
C17orf53Q8N3J3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
C17orf53Q8N3J3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
C17orf53Q8N3J3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
C17orf53Q8N3J3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
C17orf53Q8N3J3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
C17orf53Q8N3J3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
C17orf53Q8N3J3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
C17orf53Q8N3J3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
C17orf53Q8N3J3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
C17orf53Q8N3J3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
C17orf53Q8N3J3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
C17orf53Q8N3J3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
C17orf53Q8N3J3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
C17orf53Q8N3J3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
C17orf53Q8N3J3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
C17orf53Q8N3J3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
C17orf53Q8N3J3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
C17orf53Q8N3J3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
C17orf53Q8N3J3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
C17orf53Q8N3J3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
C17orf53Q8N3J3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
C17orf53Q8N3J3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
C17orf53Q8N3J3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
C17orf53Q8N3J3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
C17orf53Q8N3J3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
C17orf53Q8N3J3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
C17orf53Q8N3J3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
C17orf53Q8N3J3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms