Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0S2

SYCE1, Synaptonemal complex central element protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE1Q8N0S2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYCE1Q8N0S2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYCE1Q8N0S2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYCE1Q8N0S2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYCE1Q8N0S2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYCE1Q8N0S2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYCE1Q8N0S2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYCE1Q8N0S2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYCE1Q8N0S2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYCE1Q8N0S2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYCE1Q8N0S2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYCE1Q8N0S2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYCE1Q8N0S2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
SYCE1Q8N0S2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYCE1Q8N0S2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYCE1Q8N0S2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYCE1Q8N0S2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYCE1Q8N0S2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYCE1Q8N0S2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYCE1Q8N0S2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYCE1Q8N0S2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYCE1Q8N0S2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYCE1Q8N0S2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYCE1Q8N0S2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYCE1Q8N0S2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYCE1Q8N0S2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYCE1Q8N0S2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYCE1Q8N0S2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYCE1Q8N0S2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SYCE1Q8N0S2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYCE1Q8N0S2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYCE1Q8N0S2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYCE1Q8N0S2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYCE1Q8N0S2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYCE1Q8N0S2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
SYCE1Q8N0S2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
SYCE1Q8N0S2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYCE1Q8N0S2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYCE1Q8N0S2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYCE1Q8N0S2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYCE1Q8N0S2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYCE1Q8N0S2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYCE1Q8N0S2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYCE1Q8N0S2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYCE1Q8N0S2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYCE1Q8N0S2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYCE1Q8N0S2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYCE1Q8N0S2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYCE1Q8N0S2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYCE1Q8N0S2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYCE1Q8N0S2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYCE1Q8N0S2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYCE1Q8N0S2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYCE1Q8N0S2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYCE1Q8N0S2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYCE1Q8N0S2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SYCE1Q8N0S2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYCE1Q8N0S2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYCE1Q8N0S2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYCE1Q8N0S2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SYCE1Q8N0S2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYCE1Q8N0S2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SYCE1Q8N0S2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYCE1Q8N0S2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYCE1Q8N0S2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SYCE1Q8N0S2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYCE1Q8N0S2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYCE1Q8N0S2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYCE1Q8N0S2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYCE1Q8N0S2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYCE1Q8N0S2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYCE1Q8N0S2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYCE1Q8N0S2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYCE1Q8N0S2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYCE1Q8N0S2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYCE1Q8N0S2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYCE1Q8N0S2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SYCE1Q8N0S2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SYCE1Q8N0S2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SYCE1Q8N0S2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SYCE1Q8N0S2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SYCE1Q8N0S2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SYCE1Q8N0S2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SYCE1Q8N0S2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SYCE1Q8N0S2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SYCE1Q8N0S2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SYCE1Q8N0S2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SYCE1Q8N0S2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SYCE1Q8N0S2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SYCE1Q8N0S2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SYCE1Q8N0S2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SYCE1Q8N0S2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SYCE1Q8N0S2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SYCE1Q8N0S2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SYCE1Q8N0S2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYCE1Q8N0S2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYCE1Q8N0S2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYCE1Q8N0S2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYCE1Q8N0S2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYCE1Q8N0S2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms