Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZT9

FAM9C, Protein FAM9C, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM9CQ8IZT9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM9CQ8IZT9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM9CQ8IZT9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM9CQ8IZT9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM9CQ8IZT9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM9CQ8IZT9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM9CQ8IZT9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM9CQ8IZT9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM9CQ8IZT9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM9CQ8IZT9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM9CQ8IZT9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM9CQ8IZT9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM9CQ8IZT9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM9CQ8IZT9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM9CQ8IZT9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM9CQ8IZT9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM9CQ8IZT9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM9CQ8IZT9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM9CQ8IZT9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM9CQ8IZT9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM9CQ8IZT9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM9CQ8IZT9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM9CQ8IZT9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM9CQ8IZT9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM9CQ8IZT9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM9CQ8IZT9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM9CQ8IZT9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM9CQ8IZT9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM9CQ8IZT9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM9CQ8IZT9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM9CQ8IZT9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM9CQ8IZT9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM9CQ8IZT9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM9CQ8IZT9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM9CQ8IZT9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM9CQ8IZT9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM9CQ8IZT9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM9CQ8IZT9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM9CQ8IZT9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM9CQ8IZT9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM9CQ8IZT9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM9CQ8IZT9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM9CQ8IZT9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM9CQ8IZT9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM9CQ8IZT9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM9CQ8IZT9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM9CQ8IZT9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM9CQ8IZT9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM9CQ8IZT9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM9CQ8IZT9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM9CQ8IZT9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM9CQ8IZT9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM9CQ8IZT9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM9CQ8IZT9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM9CQ8IZT9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM9CQ8IZT9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM9CQ8IZT9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM9CQ8IZT9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FAM9CQ8IZT9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FAM9CQ8IZT9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FAM9CQ8IZT9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FAM9CQ8IZT9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FAM9CQ8IZT9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FAM9CQ8IZT9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM9CQ8IZT9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM9CQ8IZT9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM9CQ8IZT9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM9CQ8IZT9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM9CQ8IZT9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM9CQ8IZT9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM9CQ8IZT9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM9CQ8IZT9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM9CQ8IZT9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM9CQ8IZT9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM9CQ8IZT9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM9CQ8IZT9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM9CQ8IZT9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM9CQ8IZT9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM9CQ8IZT9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM9CQ8IZT9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM9CQ8IZT9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM9CQ8IZT9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM9CQ8IZT9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM9CQ8IZT9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM9CQ8IZT9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM9CQ8IZT9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM9CQ8IZT9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM9CQ8IZT9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM9CQ8IZT9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM9CQ8IZT9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM9CQ8IZT9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM9CQ8IZT9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM9CQ8IZT9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM9CQ8IZT9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM9CQ8IZT9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM9CQ8IZT9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM9CQ8IZT9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM9CQ8IZT9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM9CQ8IZT9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM9CQ8IZT9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms