Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ73

RPUSD2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD2Q8IZ73 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RPUSD2Q8IZ73 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RPUSD2Q8IZ73 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RPUSD2Q8IZ73 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RPUSD2Q8IZ73 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RPUSD2Q8IZ73 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RPUSD2Q8IZ73 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RPUSD2Q8IZ73 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RPUSD2Q8IZ73 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RPUSD2Q8IZ73 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RPUSD2Q8IZ73 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RPUSD2Q8IZ73 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RPUSD2Q8IZ73 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RPUSD2Q8IZ73 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RPUSD2Q8IZ73 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RPUSD2Q8IZ73 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RPUSD2Q8IZ73 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RPUSD2Q8IZ73 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RPUSD2Q8IZ73 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RPUSD2Q8IZ73 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RPUSD2Q8IZ73 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RPUSD2Q8IZ73 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RPUSD2Q8IZ73 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RPUSD2Q8IZ73 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RPUSD2Q8IZ73 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RPUSD2Q8IZ73 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RPUSD2Q8IZ73 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RPUSD2Q8IZ73 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RPUSD2Q8IZ73 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RPUSD2Q8IZ73 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RPUSD2Q8IZ73 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RPUSD2Q8IZ73 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29■■■□□ 2.23
RPUSD2Q8IZ73 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
RPUSD2Q8IZ73 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RPUSD2Q8IZ73 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RPUSD2Q8IZ73 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RPUSD2Q8IZ73 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
RPUSD2Q8IZ73 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RPUSD2Q8IZ73 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RPUSD2Q8IZ73 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RPUSD2Q8IZ73 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RPUSD2Q8IZ73 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RPUSD2Q8IZ73 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RPUSD2Q8IZ73 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RPUSD2Q8IZ73 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RPUSD2Q8IZ73 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
RPUSD2Q8IZ73 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RPUSD2Q8IZ73 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RPUSD2Q8IZ73 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RPUSD2Q8IZ73 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RPUSD2Q8IZ73 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RPUSD2Q8IZ73 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RPUSD2Q8IZ73 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RPUSD2Q8IZ73 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
RPUSD2Q8IZ73 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
RPUSD2Q8IZ73 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RPUSD2Q8IZ73 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RPUSD2Q8IZ73 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RPUSD2Q8IZ73 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RPUSD2Q8IZ73 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
RPUSD2Q8IZ73 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RPUSD2Q8IZ73 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RPUSD2Q8IZ73 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RPUSD2Q8IZ73 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RPUSD2Q8IZ73 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RPUSD2Q8IZ73 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RPUSD2Q8IZ73 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RPUSD2Q8IZ73 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RPUSD2Q8IZ73 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RPUSD2Q8IZ73 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RPUSD2Q8IZ73 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RPUSD2Q8IZ73 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RPUSD2Q8IZ73 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RPUSD2Q8IZ73 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RPUSD2Q8IZ73 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RPUSD2Q8IZ73 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RPUSD2Q8IZ73 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RPUSD2Q8IZ73 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RPUSD2Q8IZ73 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
RPUSD2Q8IZ73 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RPUSD2Q8IZ73 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RPUSD2Q8IZ73 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RPUSD2Q8IZ73 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RPUSD2Q8IZ73 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RPUSD2Q8IZ73 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RPUSD2Q8IZ73 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RPUSD2Q8IZ73 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
RPUSD2Q8IZ73 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RPUSD2Q8IZ73 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RPUSD2Q8IZ73 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RPUSD2Q8IZ73 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RPUSD2Q8IZ73 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RPUSD2Q8IZ73 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.2
RPUSD2Q8IZ73 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RPUSD2Q8IZ73 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RPUSD2Q8IZ73 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RPUSD2Q8IZ73 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RPUSD2Q8IZ73 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RPUSD2Q8IZ73 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RPUSD2Q8IZ73 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms