Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVL6

P3H3, Prolyl 3-hydroxylase 3, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H3Q8IVL6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.97■■■■■ 4.31
P3H3Q8IVL6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
P3H3Q8IVL6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
P3H3Q8IVL6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.97■■■■■ 4.31
P3H3Q8IVL6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.96■■■■■ 4.31
P3H3Q8IVL6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
P3H3Q8IVL6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
P3H3Q8IVL6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
P3H3Q8IVL6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC41.95■■■■■ 4.31
P3H3Q8IVL6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
P3H3Q8IVL6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
P3H3Q8IVL6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
P3H3Q8IVL6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
P3H3Q8IVL6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
P3H3Q8IVL6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC41.94■■■■■ 4.3
P3H3Q8IVL6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC41.94■■■■■ 4.3
P3H3Q8IVL6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
P3H3Q8IVL6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
P3H3Q8IVL6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC41.92■■■■■ 4.3
P3H3Q8IVL6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
P3H3Q8IVL6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
P3H3Q8IVL6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
P3H3Q8IVL6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC41.91■■■■■ 4.3
P3H3Q8IVL6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
P3H3Q8IVL6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
P3H3Q8IVL6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
P3H3Q8IVL6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC41.88■■■■■ 4.29
P3H3Q8IVL6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC41.87■■■■■ 4.29
P3H3Q8IVL6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
P3H3Q8IVL6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
P3H3Q8IVL6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
P3H3Q8IVL6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
P3H3Q8IVL6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC41.84■■■■■ 4.29
P3H3Q8IVL6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
P3H3Q8IVL6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
P3H3Q8IVL6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
P3H3Q8IVL6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC41.82■■■■■ 4.29
P3H3Q8IVL6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC41.81■■■■■ 4.28
P3H3Q8IVL6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC41.81■■■■■ 4.28
P3H3Q8IVL6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
P3H3Q8IVL6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC41.8■■■■■ 4.28
P3H3Q8IVL6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.78■■■■■ 4.28
P3H3Q8IVL6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC41.78■■■■■ 4.28
P3H3Q8IVL6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC41.78■■■■■ 4.28
P3H3Q8IVL6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
P3H3Q8IVL6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
P3H3Q8IVL6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC41.75■■■■■ 4.27
P3H3Q8IVL6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC41.74■■■■■ 4.27
P3H3Q8IVL6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.74■■■■■ 4.27
P3H3Q8IVL6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
P3H3Q8IVL6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
P3H3Q8IVL6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
P3H3Q8IVL6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
P3H3Q8IVL6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC41.72■■■■■ 4.27
P3H3Q8IVL6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.72■■■■■ 4.27
P3H3Q8IVL6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.7■■■■■ 4.27
P3H3Q8IVL6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC41.67■■■■■ 4.26
P3H3Q8IVL6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
P3H3Q8IVL6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.67■■■■■ 4.26
P3H3Q8IVL6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
P3H3Q8IVL6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
P3H3Q8IVL6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
P3H3Q8IVL6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC41.64■■■■■ 4.26
P3H3Q8IVL6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.63■■■■■ 4.26
P3H3Q8IVL6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
P3H3Q8IVL6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
P3H3Q8IVL6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC41.62■■■■■ 4.25
P3H3Q8IVL6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
P3H3Q8IVL6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC41.61■■■■■ 4.25
P3H3Q8IVL6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.61■■■■■ 4.25
P3H3Q8IVL6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC41.61■■■■■ 4.25
P3H3Q8IVL6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
P3H3Q8IVL6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
P3H3Q8IVL6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
P3H3Q8IVL6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
P3H3Q8IVL6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC41.59■■■■■ 4.25
P3H3Q8IVL6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC41.59■■■■■ 4.25
P3H3Q8IVL6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
P3H3Q8IVL6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
P3H3Q8IVL6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
P3H3Q8IVL6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC41.58■■■■■ 4.25
P3H3Q8IVL6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC41.57■■■■■ 4.25
P3H3Q8IVL6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC41.57■■■■■ 4.25
P3H3Q8IVL6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.25
P3H3Q8IVL6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
P3H3Q8IVL6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
P3H3Q8IVL6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC41.54■■■■■ 4.24
P3H3Q8IVL6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
P3H3Q8IVL6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC41.53■■■■■ 4.24
P3H3Q8IVL6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
P3H3Q8IVL6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
P3H3Q8IVL6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC41.5■■■■■ 4.23
P3H3Q8IVL6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC41.5■■■■■ 4.23
P3H3Q8IVL6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
P3H3Q8IVL6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC41.49■■■■■ 4.23
P3H3Q8IVL6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
P3H3Q8IVL6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.49■■■■■ 4.23
P3H3Q8IVL6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC41.48■■■■■ 4.23
P3H3Q8IVL6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC41.48■■■■■ 4.23
P3H3Q8IVL6 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms