Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV61

RASGRP3, Ras guanyl-releasing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRP3Q8IV61 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RASGRP3Q8IV61 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RASGRP3Q8IV61 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RASGRP3Q8IV61 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RASGRP3Q8IV61 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RASGRP3Q8IV61 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RASGRP3Q8IV61 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RASGRP3Q8IV61 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RASGRP3Q8IV61 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RASGRP3Q8IV61 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RASGRP3Q8IV61 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RASGRP3Q8IV61 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RASGRP3Q8IV61 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RASGRP3Q8IV61 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RASGRP3Q8IV61 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RASGRP3Q8IV61 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RASGRP3Q8IV61 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RASGRP3Q8IV61 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RASGRP3Q8IV61 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RASGRP3Q8IV61 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RASGRP3Q8IV61 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RASGRP3Q8IV61 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RASGRP3Q8IV61 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RASGRP3Q8IV61 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RASGRP3Q8IV61 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RASGRP3Q8IV61 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RASGRP3Q8IV61 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RASGRP3Q8IV61 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RASGRP3Q8IV61 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RASGRP3Q8IV61 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RASGRP3Q8IV61 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RASGRP3Q8IV61 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RASGRP3Q8IV61 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RASGRP3Q8IV61 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RASGRP3Q8IV61 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RASGRP3Q8IV61 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RASGRP3Q8IV61 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RASGRP3Q8IV61 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RASGRP3Q8IV61 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RASGRP3Q8IV61 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RASGRP3Q8IV61 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RASGRP3Q8IV61 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RASGRP3Q8IV61 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RASGRP3Q8IV61 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RASGRP3Q8IV61 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RASGRP3Q8IV61 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RASGRP3Q8IV61 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RASGRP3Q8IV61 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RASGRP3Q8IV61 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RASGRP3Q8IV61 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RASGRP3Q8IV61 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RASGRP3Q8IV61 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RASGRP3Q8IV61 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RASGRP3Q8IV61 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RASGRP3Q8IV61 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RASGRP3Q8IV61 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RASGRP3Q8IV61 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RASGRP3Q8IV61 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RASGRP3Q8IV61 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RASGRP3Q8IV61 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RASGRP3Q8IV61 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RASGRP3Q8IV61 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RASGRP3Q8IV61 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RASGRP3Q8IV61 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RASGRP3Q8IV61 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RASGRP3Q8IV61 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RASGRP3Q8IV61 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RASGRP3Q8IV61 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RASGRP3Q8IV61 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RASGRP3Q8IV61 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RASGRP3Q8IV61 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RASGRP3Q8IV61 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RASGRP3Q8IV61 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RASGRP3Q8IV61 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RASGRP3Q8IV61 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RASGRP3Q8IV61 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RASGRP3Q8IV61 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RASGRP3Q8IV61 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RASGRP3Q8IV61 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RASGRP3Q8IV61 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RASGRP3Q8IV61 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RASGRP3Q8IV61 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RASGRP3Q8IV61 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RASGRP3Q8IV61 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RASGRP3Q8IV61 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RASGRP3Q8IV61 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RASGRP3Q8IV61 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RASGRP3Q8IV61 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RASGRP3Q8IV61 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RASGRP3Q8IV61 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RASGRP3Q8IV61 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RASGRP3Q8IV61 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RASGRP3Q8IV61 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RASGRP3Q8IV61 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RASGRP3Q8IV61 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RASGRP3Q8IV61 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RASGRP3Q8IV61 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RASGRP3Q8IV61 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RASGRP3Q8IV61 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RASGRP3Q8IV61 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms