Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU80

TMPRSS6, Transmembrane protease serine 6, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS6Q8IU80 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMPRSS6Q8IU80 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMPRSS6Q8IU80 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMPRSS6Q8IU80 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMPRSS6Q8IU80 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMPRSS6Q8IU80 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMPRSS6Q8IU80 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMPRSS6Q8IU80 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMPRSS6Q8IU80 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
TMPRSS6Q8IU80 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMPRSS6Q8IU80 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMPRSS6Q8IU80 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMPRSS6Q8IU80 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMPRSS6Q8IU80 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
TMPRSS6Q8IU80 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMPRSS6Q8IU80 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMPRSS6Q8IU80 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMPRSS6Q8IU80 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMPRSS6Q8IU80 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMPRSS6Q8IU80 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMPRSS6Q8IU80 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TMPRSS6Q8IU80 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TMPRSS6Q8IU80 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMPRSS6Q8IU80 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMPRSS6Q8IU80 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMPRSS6Q8IU80 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMPRSS6Q8IU80 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMPRSS6Q8IU80 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMPRSS6Q8IU80 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMPRSS6Q8IU80 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMPRSS6Q8IU80 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMPRSS6Q8IU80 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMPRSS6Q8IU80 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMPRSS6Q8IU80 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMPRSS6Q8IU80 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMPRSS6Q8IU80 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMPRSS6Q8IU80 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMPRSS6Q8IU80 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMPRSS6Q8IU80 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
TMPRSS6Q8IU80 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMPRSS6Q8IU80 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMPRSS6Q8IU80 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMPRSS6Q8IU80 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMPRSS6Q8IU80 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMPRSS6Q8IU80 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMPRSS6Q8IU80 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.58■■□□□ 1.84
TMPRSS6Q8IU80 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMPRSS6Q8IU80 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMPRSS6Q8IU80 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMPRSS6Q8IU80 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMPRSS6Q8IU80 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMPRSS6Q8IU80 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMPRSS6Q8IU80 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMPRSS6Q8IU80 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMPRSS6Q8IU80 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMPRSS6Q8IU80 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMPRSS6Q8IU80 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMPRSS6Q8IU80 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMPRSS6Q8IU80 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMPRSS6Q8IU80 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMPRSS6Q8IU80 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMPRSS6Q8IU80 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMPRSS6Q8IU80 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMPRSS6Q8IU80 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMPRSS6Q8IU80 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMPRSS6Q8IU80 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMPRSS6Q8IU80 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMPRSS6Q8IU80 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMPRSS6Q8IU80 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMPRSS6Q8IU80 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMPRSS6Q8IU80 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TMPRSS6Q8IU80 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TMPRSS6Q8IU80 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TMPRSS6Q8IU80 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TMPRSS6Q8IU80 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TMPRSS6Q8IU80 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TMPRSS6Q8IU80 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TMPRSS6Q8IU80 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TMPRSS6Q8IU80 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TMPRSS6Q8IU80 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMPRSS6Q8IU80 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMPRSS6Q8IU80 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMPRSS6Q8IU80 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMPRSS6Q8IU80 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMPRSS6Q8IU80 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMPRSS6Q8IU80 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMPRSS6Q8IU80 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMPRSS6Q8IU80 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMPRSS6Q8IU80 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMPRSS6Q8IU80 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMPRSS6Q8IU80 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMPRSS6Q8IU80 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMPRSS6Q8IU80 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMPRSS6Q8IU80 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMPRSS6Q8IU80 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMPRSS6Q8IU80 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMPRSS6Q8IU80 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMPRSS6Q8IU80 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMPRSS6Q8IU80 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TMPRSS6Q8IU80 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms