Protein–RNA interactions for Protein: Q86W92

PPFIBP1, Liprin-beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP1Q86W92 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PPFIBP1Q86W92 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PPFIBP1Q86W92 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PPFIBP1Q86W92 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PPFIBP1Q86W92 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
PPFIBP1Q86W92 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PPFIBP1Q86W92 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PPFIBP1Q86W92 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PPFIBP1Q86W92 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PPFIBP1Q86W92 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PPFIBP1Q86W92 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PPFIBP1Q86W92 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PPFIBP1Q86W92 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PPFIBP1Q86W92 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PPFIBP1Q86W92 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PPFIBP1Q86W92 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
PPFIBP1Q86W92 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PPFIBP1Q86W92 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PPFIBP1Q86W92 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PPFIBP1Q86W92 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PPFIBP1Q86W92 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PPFIBP1Q86W92 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PPFIBP1Q86W92 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PPFIBP1Q86W92 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
PPFIBP1Q86W92 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PPFIBP1Q86W92 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PPFIBP1Q86W92 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PPFIBP1Q86W92 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PPFIBP1Q86W92 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PPFIBP1Q86W92 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PPFIBP1Q86W92 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PPFIBP1Q86W92 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PPFIBP1Q86W92 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PPFIBP1Q86W92 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PPFIBP1Q86W92 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PPFIBP1Q86W92 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PPFIBP1Q86W92 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PPFIBP1Q86W92 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PPFIBP1Q86W92 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PPFIBP1Q86W92 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PPFIBP1Q86W92 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PPFIBP1Q86W92 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PPFIBP1Q86W92 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PPFIBP1Q86W92 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PPFIBP1Q86W92 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PPFIBP1Q86W92 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PPFIBP1Q86W92 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PPFIBP1Q86W92 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
PPFIBP1Q86W92 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PPFIBP1Q86W92 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PPFIBP1Q86W92 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PPFIBP1Q86W92 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PPFIBP1Q86W92 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PPFIBP1Q86W92 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PPFIBP1Q86W92 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PPFIBP1Q86W92 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PPFIBP1Q86W92 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PPFIBP1Q86W92 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
PPFIBP1Q86W92 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
PPFIBP1Q86W92 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PPFIBP1Q86W92 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PPFIBP1Q86W92 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PPFIBP1Q86W92 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PPFIBP1Q86W92 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PPFIBP1Q86W92 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PPFIBP1Q86W92 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PPFIBP1Q86W92 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PPFIBP1Q86W92 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PPFIBP1Q86W92 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PPFIBP1Q86W92 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PPFIBP1Q86W92 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PPFIBP1Q86W92 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PPFIBP1Q86W92 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PPFIBP1Q86W92 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
PPFIBP1Q86W92 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PPFIBP1Q86W92 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PPFIBP1Q86W92 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PPFIBP1Q86W92 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PPFIBP1Q86W92 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PPFIBP1Q86W92 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PPFIBP1Q86W92 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PPFIBP1Q86W92 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PPFIBP1Q86W92 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PPFIBP1Q86W92 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PPFIBP1Q86W92 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PPFIBP1Q86W92 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PPFIBP1Q86W92 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PPFIBP1Q86W92 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PPFIBP1Q86W92 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PPFIBP1Q86W92 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PPFIBP1Q86W92 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PPFIBP1Q86W92 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PPFIBP1Q86W92 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PPFIBP1Q86W92 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PPFIBP1Q86W92 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PPFIBP1Q86W92 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PPFIBP1Q86W92 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PPFIBP1Q86W92 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PPFIBP1Q86W92 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PPFIBP1Q86W92 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms