Protein–RNA interactions for Protein: Q86W25

NLRP13, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP13Q86W25 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
NLRP13Q86W25 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
NLRP13Q86W25 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
NLRP13Q86W25 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
NLRP13Q86W25 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
NLRP13Q86W25 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
NLRP13Q86W25 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
NLRP13Q86W25 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
NLRP13Q86W25 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
NLRP13Q86W25 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
NLRP13Q86W25 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
NLRP13Q86W25 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
NLRP13Q86W25 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
NLRP13Q86W25 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
NLRP13Q86W25 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
NLRP13Q86W25 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
NLRP13Q86W25 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
NLRP13Q86W25 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
NLRP13Q86W25 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
NLRP13Q86W25 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
NLRP13Q86W25 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
NLRP13Q86W25 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
NLRP13Q86W25 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
NLRP13Q86W25 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC36.1■■■■□ 3.37
NLRP13Q86W25 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC36.1■■■■□ 3.37
NLRP13Q86W25 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
NLRP13Q86W25 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
NLRP13Q86W25 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
NLRP13Q86W25 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
NLRP13Q86W25 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
NLRP13Q86W25 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
NLRP13Q86W25 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
NLRP13Q86W25 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
NLRP13Q86W25 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
NLRP13Q86W25 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
NLRP13Q86W25 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
NLRP13Q86W25 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
NLRP13Q86W25 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
NLRP13Q86W25 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
NLRP13Q86W25 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
NLRP13Q86W25 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
NLRP13Q86W25 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
NLRP13Q86W25 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
NLRP13Q86W25 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
NLRP13Q86W25 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.36
NLRP13Q86W25 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC36■■■■□ 3.35
NLRP13Q86W25 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
NLRP13Q86W25 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
NLRP13Q86W25 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
NLRP13Q86W25 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
NLRP13Q86W25 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
NLRP13Q86W25 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC35.98■■■■□ 3.35
NLRP13Q86W25 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
NLRP13Q86W25 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
NLRP13Q86W25 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
NLRP13Q86W25 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
NLRP13Q86W25 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
NLRP13Q86W25 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
NLRP13Q86W25 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
NLRP13Q86W25 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
NLRP13Q86W25 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
NLRP13Q86W25 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
NLRP13Q86W25 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
NLRP13Q86W25 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
NLRP13Q86W25 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
NLRP13Q86W25 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
NLRP13Q86W25 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
NLRP13Q86W25 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.33
NLRP13Q86W25 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
NLRP13Q86W25 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
NLRP13Q86W25 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
NLRP13Q86W25 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
NLRP13Q86W25 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC35.84■■■■□ 3.33
NLRP13Q86W25 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
NLRP13Q86W25 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
NLRP13Q86W25 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
NLRP13Q86W25 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
NLRP13Q86W25 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC35.82■■■■□ 3.32
NLRP13Q86W25 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC35.82■■■■□ 3.32
NLRP13Q86W25 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
NLRP13Q86W25 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
NLRP13Q86W25 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
NLRP13Q86W25 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
NLRP13Q86W25 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
NLRP13Q86W25 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
NLRP13Q86W25 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
NLRP13Q86W25 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
NLRP13Q86W25 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
NLRP13Q86W25 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
NLRP13Q86W25 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
NLRP13Q86W25 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
NLRP13Q86W25 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
NLRP13Q86W25 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
NLRP13Q86W25 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
NLRP13Q86W25 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
NLRP13Q86W25 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
NLRP13Q86W25 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
NLRP13Q86W25 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
NLRP13Q86W25 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
NLRP13Q86W25 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms