Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATG4DQ86TL0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATG4DQ86TL0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATG4DQ86TL0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ATG4DQ86TL0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATG4DQ86TL0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ATG4DQ86TL0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATG4DQ86TL0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATG4DQ86TL0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATG4DQ86TL0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATG4DQ86TL0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATG4DQ86TL0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATG4DQ86TL0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATG4DQ86TL0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATG4DQ86TL0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATG4DQ86TL0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATG4DQ86TL0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATG4DQ86TL0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATG4DQ86TL0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATG4DQ86TL0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATG4DQ86TL0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATG4DQ86TL0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ATG4DQ86TL0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATG4DQ86TL0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATG4DQ86TL0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATG4DQ86TL0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATG4DQ86TL0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATG4DQ86TL0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATG4DQ86TL0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATG4DQ86TL0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATG4DQ86TL0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATG4DQ86TL0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATG4DQ86TL0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATG4DQ86TL0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATG4DQ86TL0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATG4DQ86TL0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ATG4DQ86TL0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ATG4DQ86TL0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATG4DQ86TL0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATG4DQ86TL0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATG4DQ86TL0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATG4DQ86TL0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATG4DQ86TL0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATG4DQ86TL0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ATG4DQ86TL0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATG4DQ86TL0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATG4DQ86TL0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATG4DQ86TL0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATG4DQ86TL0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATG4DQ86TL0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATG4DQ86TL0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATG4DQ86TL0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATG4DQ86TL0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG4DQ86TL0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG4DQ86TL0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG4DQ86TL0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG4DQ86TL0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG4DQ86TL0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATG4DQ86TL0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ATG4DQ86TL0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG4DQ86TL0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG4DQ86TL0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG4DQ86TL0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG4DQ86TL0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG4DQ86TL0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG4DQ86TL0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG4DQ86TL0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG4DQ86TL0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG4DQ86TL0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG4DQ86TL0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG4DQ86TL0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG4DQ86TL0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG4DQ86TL0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG4DQ86TL0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG4DQ86TL0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG4DQ86TL0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG4DQ86TL0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG4DQ86TL0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATG4DQ86TL0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG4DQ86TL0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG4DQ86TL0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG4DQ86TL0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG4DQ86TL0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG4DQ86TL0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATG4DQ86TL0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATG4DQ86TL0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATG4DQ86TL0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATG4DQ86TL0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATG4DQ86TL0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATG4DQ86TL0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATG4DQ86TL0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATG4DQ86TL0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATG4DQ86TL0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATG4DQ86TL0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATG4DQ86TL0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATG4DQ86TL0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ATG4DQ86TL0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATG4DQ86TL0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATG4DQ86TL0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATG4DQ86TL0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms