Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z4V0

ZNF438, Zinc finger protein 438, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF438Q7Z4V0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF438Q7Z4V0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF438Q7Z4V0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF438Q7Z4V0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF438Q7Z4V0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF438Q7Z4V0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF438Q7Z4V0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF438Q7Z4V0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF438Q7Z4V0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF438Q7Z4V0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF438Q7Z4V0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZNF438Q7Z4V0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZNF438Q7Z4V0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZNF438Q7Z4V0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF438Q7Z4V0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF438Q7Z4V0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF438Q7Z4V0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF438Q7Z4V0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF438Q7Z4V0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF438Q7Z4V0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF438Q7Z4V0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF438Q7Z4V0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF438Q7Z4V0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF438Q7Z4V0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF438Q7Z4V0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF438Q7Z4V0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF438Q7Z4V0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF438Q7Z4V0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF438Q7Z4V0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF438Q7Z4V0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF438Q7Z4V0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF438Q7Z4V0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF438Q7Z4V0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF438Q7Z4V0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF438Q7Z4V0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF438Q7Z4V0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF438Q7Z4V0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF438Q7Z4V0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF438Q7Z4V0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF438Q7Z4V0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF438Q7Z4V0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF438Q7Z4V0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF438Q7Z4V0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF438Q7Z4V0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF438Q7Z4V0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF438Q7Z4V0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF438Q7Z4V0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF438Q7Z4V0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF438Q7Z4V0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF438Q7Z4V0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF438Q7Z4V0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF438Q7Z4V0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF438Q7Z4V0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF438Q7Z4V0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF438Q7Z4V0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF438Q7Z4V0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF438Q7Z4V0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF438Q7Z4V0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF438Q7Z4V0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF438Q7Z4V0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF438Q7Z4V0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF438Q7Z4V0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF438Q7Z4V0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF438Q7Z4V0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF438Q7Z4V0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF438Q7Z4V0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF438Q7Z4V0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF438Q7Z4V0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF438Q7Z4V0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF438Q7Z4V0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF438Q7Z4V0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF438Q7Z4V0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF438Q7Z4V0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF438Q7Z4V0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF438Q7Z4V0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF438Q7Z4V0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF438Q7Z4V0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF438Q7Z4V0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF438Q7Z4V0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF438Q7Z4V0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF438Q7Z4V0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF438Q7Z4V0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF438Q7Z4V0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF438Q7Z4V0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF438Q7Z4V0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF438Q7Z4V0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF438Q7Z4V0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF438Q7Z4V0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF438Q7Z4V0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF438Q7Z4V0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF438Q7Z4V0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZNF438Q7Z4V0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ZNF438Q7Z4V0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZNF438Q7Z4V0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF438Q7Z4V0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF438Q7Z4V0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF438Q7Z4V0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF438Q7Z4V0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF438Q7Z4V0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF438Q7Z4V0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms