Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z4H3

HDDC2, HD domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC2Q7Z4H3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDDC2Q7Z4H3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDDC2Q7Z4H3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDDC2Q7Z4H3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HDDC2Q7Z4H3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HDDC2Q7Z4H3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDDC2Q7Z4H3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDDC2Q7Z4H3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDDC2Q7Z4H3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDDC2Q7Z4H3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDDC2Q7Z4H3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDDC2Q7Z4H3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDDC2Q7Z4H3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDDC2Q7Z4H3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDDC2Q7Z4H3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDDC2Q7Z4H3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDDC2Q7Z4H3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDDC2Q7Z4H3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDDC2Q7Z4H3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDDC2Q7Z4H3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDDC2Q7Z4H3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDDC2Q7Z4H3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDDC2Q7Z4H3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDDC2Q7Z4H3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDDC2Q7Z4H3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDDC2Q7Z4H3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDDC2Q7Z4H3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDDC2Q7Z4H3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDDC2Q7Z4H3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDDC2Q7Z4H3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDDC2Q7Z4H3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDDC2Q7Z4H3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDDC2Q7Z4H3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDDC2Q7Z4H3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDDC2Q7Z4H3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HDDC2Q7Z4H3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDDC2Q7Z4H3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDDC2Q7Z4H3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDDC2Q7Z4H3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDDC2Q7Z4H3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HDDC2Q7Z4H3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDDC2Q7Z4H3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDDC2Q7Z4H3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDDC2Q7Z4H3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDDC2Q7Z4H3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDDC2Q7Z4H3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDDC2Q7Z4H3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDDC2Q7Z4H3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDDC2Q7Z4H3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDDC2Q7Z4H3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HDDC2Q7Z4H3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDDC2Q7Z4H3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDDC2Q7Z4H3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDDC2Q7Z4H3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HDDC2Q7Z4H3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDDC2Q7Z4H3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDDC2Q7Z4H3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDDC2Q7Z4H3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDDC2Q7Z4H3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDDC2Q7Z4H3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HDDC2Q7Z4H3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDDC2Q7Z4H3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDDC2Q7Z4H3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HDDC2Q7Z4H3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDDC2Q7Z4H3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDDC2Q7Z4H3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDDC2Q7Z4H3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDDC2Q7Z4H3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDDC2Q7Z4H3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDDC2Q7Z4H3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDDC2Q7Z4H3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDDC2Q7Z4H3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDDC2Q7Z4H3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDDC2Q7Z4H3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDDC2Q7Z4H3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDDC2Q7Z4H3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HDDC2Q7Z4H3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDDC2Q7Z4H3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HDDC2Q7Z4H3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDDC2Q7Z4H3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDDC2Q7Z4H3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDDC2Q7Z4H3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDDC2Q7Z4H3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDDC2Q7Z4H3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDDC2Q7Z4H3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDDC2Q7Z4H3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDDC2Q7Z4H3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDDC2Q7Z4H3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDDC2Q7Z4H3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDDC2Q7Z4H3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDDC2Q7Z4H3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDDC2Q7Z4H3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDDC2Q7Z4H3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDDC2Q7Z4H3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDDC2Q7Z4H3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDDC2Q7Z4H3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDDC2Q7Z4H3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDDC2Q7Z4H3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDDC2Q7Z4H3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDDC2Q7Z4H3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms