Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3V4

UBE3B, Ubiquitin-protein ligase E3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3BQ7Z3V4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
UBE3BQ7Z3V4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
UBE3BQ7Z3V4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
UBE3BQ7Z3V4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
UBE3BQ7Z3V4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
UBE3BQ7Z3V4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
UBE3BQ7Z3V4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
UBE3BQ7Z3V4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
UBE3BQ7Z3V4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
UBE3BQ7Z3V4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
UBE3BQ7Z3V4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC32.7■■■□□ 2.83
UBE3BQ7Z3V4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
UBE3BQ7Z3V4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
UBE3BQ7Z3V4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
UBE3BQ7Z3V4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
UBE3BQ7Z3V4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
UBE3BQ7Z3V4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
UBE3BQ7Z3V4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
UBE3BQ7Z3V4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
UBE3BQ7Z3V4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
UBE3BQ7Z3V4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
UBE3BQ7Z3V4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
UBE3BQ7Z3V4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
UBE3BQ7Z3V4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
UBE3BQ7Z3V4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
UBE3BQ7Z3V4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
UBE3BQ7Z3V4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
UBE3BQ7Z3V4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
UBE3BQ7Z3V4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
UBE3BQ7Z3V4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
UBE3BQ7Z3V4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
UBE3BQ7Z3V4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
UBE3BQ7Z3V4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
UBE3BQ7Z3V4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
UBE3BQ7Z3V4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
UBE3BQ7Z3V4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
UBE3BQ7Z3V4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC32.65■■■□□ 2.82
UBE3BQ7Z3V4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
UBE3BQ7Z3V4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
UBE3BQ7Z3V4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
UBE3BQ7Z3V4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
UBE3BQ7Z3V4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
UBE3BQ7Z3V4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
UBE3BQ7Z3V4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
UBE3BQ7Z3V4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
UBE3BQ7Z3V4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
UBE3BQ7Z3V4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
UBE3BQ7Z3V4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
UBE3BQ7Z3V4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
UBE3BQ7Z3V4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
UBE3BQ7Z3V4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
UBE3BQ7Z3V4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
UBE3BQ7Z3V4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
UBE3BQ7Z3V4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
UBE3BQ7Z3V4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
UBE3BQ7Z3V4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
UBE3BQ7Z3V4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
UBE3BQ7Z3V4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
UBE3BQ7Z3V4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.54■■■□□ 2.8
UBE3BQ7Z3V4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
UBE3BQ7Z3V4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
UBE3BQ7Z3V4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
UBE3BQ7Z3V4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
UBE3BQ7Z3V4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
UBE3BQ7Z3V4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
UBE3BQ7Z3V4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
UBE3BQ7Z3V4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
UBE3BQ7Z3V4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
UBE3BQ7Z3V4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
UBE3BQ7Z3V4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
UBE3BQ7Z3V4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
UBE3BQ7Z3V4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
UBE3BQ7Z3V4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
UBE3BQ7Z3V4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
UBE3BQ7Z3V4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
UBE3BQ7Z3V4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
UBE3BQ7Z3V4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
UBE3BQ7Z3V4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
UBE3BQ7Z3V4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
UBE3BQ7Z3V4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
UBE3BQ7Z3V4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
UBE3BQ7Z3V4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
UBE3BQ7Z3V4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
UBE3BQ7Z3V4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
UBE3BQ7Z3V4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
UBE3BQ7Z3V4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
UBE3BQ7Z3V4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
UBE3BQ7Z3V4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
UBE3BQ7Z3V4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
UBE3BQ7Z3V4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
UBE3BQ7Z3V4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
UBE3BQ7Z3V4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
UBE3BQ7Z3V4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
UBE3BQ7Z3V4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
UBE3BQ7Z3V4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
UBE3BQ7Z3V4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
UBE3BQ7Z3V4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
UBE3BQ7Z3V4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
UBE3BQ7Z3V4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
UBE3BQ7Z3V4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.2 ms