Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS6

OTOP2, Otopetrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP2Q7RTS6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
OTOP2Q7RTS6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
OTOP2Q7RTS6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
OTOP2Q7RTS6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
OTOP2Q7RTS6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
OTOP2Q7RTS6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
OTOP2Q7RTS6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
OTOP2Q7RTS6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
OTOP2Q7RTS6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
OTOP2Q7RTS6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
OTOP2Q7RTS6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
OTOP2Q7RTS6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
OTOP2Q7RTS6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
OTOP2Q7RTS6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
OTOP2Q7RTS6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
OTOP2Q7RTS6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
OTOP2Q7RTS6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
OTOP2Q7RTS6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
OTOP2Q7RTS6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
OTOP2Q7RTS6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
OTOP2Q7RTS6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
OTOP2Q7RTS6 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
OTOP2Q7RTS6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
OTOP2Q7RTS6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
OTOP2Q7RTS6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
OTOP2Q7RTS6 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
OTOP2Q7RTS6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
OTOP2Q7RTS6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
OTOP2Q7RTS6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
OTOP2Q7RTS6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
OTOP2Q7RTS6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
OTOP2Q7RTS6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
OTOP2Q7RTS6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
OTOP2Q7RTS6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
OTOP2Q7RTS6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
OTOP2Q7RTS6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
OTOP2Q7RTS6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
OTOP2Q7RTS6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
OTOP2Q7RTS6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
OTOP2Q7RTS6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
OTOP2Q7RTS6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
OTOP2Q7RTS6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
OTOP2Q7RTS6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
OTOP2Q7RTS6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
OTOP2Q7RTS6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
OTOP2Q7RTS6 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
OTOP2Q7RTS6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
OTOP2Q7RTS6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
OTOP2Q7RTS6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
OTOP2Q7RTS6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
OTOP2Q7RTS6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
OTOP2Q7RTS6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
OTOP2Q7RTS6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
OTOP2Q7RTS6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
OTOP2Q7RTS6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
OTOP2Q7RTS6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
OTOP2Q7RTS6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
OTOP2Q7RTS6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
OTOP2Q7RTS6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
OTOP2Q7RTS6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
OTOP2Q7RTS6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
OTOP2Q7RTS6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
OTOP2Q7RTS6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
OTOP2Q7RTS6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
OTOP2Q7RTS6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
OTOP2Q7RTS6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
OTOP2Q7RTS6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
OTOP2Q7RTS6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
OTOP2Q7RTS6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
OTOP2Q7RTS6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
OTOP2Q7RTS6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
OTOP2Q7RTS6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
OTOP2Q7RTS6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
OTOP2Q7RTS6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
OTOP2Q7RTS6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
OTOP2Q7RTS6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
OTOP2Q7RTS6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
OTOP2Q7RTS6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
OTOP2Q7RTS6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
OTOP2Q7RTS6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
OTOP2Q7RTS6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
OTOP2Q7RTS6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
OTOP2Q7RTS6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
OTOP2Q7RTS6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
OTOP2Q7RTS6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
OTOP2Q7RTS6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
OTOP2Q7RTS6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
OTOP2Q7RTS6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
OTOP2Q7RTS6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
OTOP2Q7RTS6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
OTOP2Q7RTS6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
OTOP2Q7RTS6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
OTOP2Q7RTS6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
OTOP2Q7RTS6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
OTOP2Q7RTS6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
OTOP2Q7RTS6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
OTOP2Q7RTS6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
OTOP2Q7RTS6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
OTOP2Q7RTS6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
OTOP2Q7RTS6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms