Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
PTF1AQ7RTS3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
PTF1AQ7RTS3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC34.38■■■■□ 3.09
PTF1AQ7RTS3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
PTF1AQ7RTS3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
PTF1AQ7RTS3 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
PTF1AQ7RTS3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
PTF1AQ7RTS3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
PTF1AQ7RTS3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
PTF1AQ7RTS3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
PTF1AQ7RTS3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
PTF1AQ7RTS3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
PTF1AQ7RTS3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
PTF1AQ7RTS3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
PTF1AQ7RTS3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PTF1AQ7RTS3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PTF1AQ7RTS3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
PTF1AQ7RTS3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
PTF1AQ7RTS3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
PTF1AQ7RTS3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
PTF1AQ7RTS3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
PTF1AQ7RTS3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC34.27■■■■□ 3.08
PTF1AQ7RTS3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
PTF1AQ7RTS3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
PTF1AQ7RTS3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
PTF1AQ7RTS3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
PTF1AQ7RTS3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
PTF1AQ7RTS3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
PTF1AQ7RTS3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
PTF1AQ7RTS3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
PTF1AQ7RTS3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
PTF1AQ7RTS3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
PTF1AQ7RTS3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
PTF1AQ7RTS3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
PTF1AQ7RTS3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
PTF1AQ7RTS3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PTF1AQ7RTS3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
PTF1AQ7RTS3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
PTF1AQ7RTS3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
PTF1AQ7RTS3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PTF1AQ7RTS3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PTF1AQ7RTS3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PTF1AQ7RTS3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
PTF1AQ7RTS3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
PTF1AQ7RTS3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
PTF1AQ7RTS3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
PTF1AQ7RTS3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
PTF1AQ7RTS3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
PTF1AQ7RTS3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
PTF1AQ7RTS3 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
PTF1AQ7RTS3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
PTF1AQ7RTS3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
PTF1AQ7RTS3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
PTF1AQ7RTS3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PTF1AQ7RTS3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
PTF1AQ7RTS3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
PTF1AQ7RTS3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
PTF1AQ7RTS3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
PTF1AQ7RTS3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
PTF1AQ7RTS3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
PTF1AQ7RTS3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
PTF1AQ7RTS3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
PTF1AQ7RTS3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
PTF1AQ7RTS3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
PTF1AQ7RTS3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
PTF1AQ7RTS3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
PTF1AQ7RTS3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
PTF1AQ7RTS3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
PTF1AQ7RTS3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
PTF1AQ7RTS3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PTF1AQ7RTS3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
PTF1AQ7RTS3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
PTF1AQ7RTS3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PTF1AQ7RTS3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PTF1AQ7RTS3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PTF1AQ7RTS3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PTF1AQ7RTS3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
PTF1AQ7RTS3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
PTF1AQ7RTS3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
PTF1AQ7RTS3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PTF1AQ7RTS3 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PTF1AQ7RTS3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
PTF1AQ7RTS3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PTF1AQ7RTS3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
PTF1AQ7RTS3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PTF1AQ7RTS3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
PTF1AQ7RTS3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
PTF1AQ7RTS3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
PTF1AQ7RTS3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
PTF1AQ7RTS3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
PTF1AQ7RTS3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PTF1AQ7RTS3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
PTF1AQ7RTS3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PTF1AQ7RTS3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
PTF1AQ7RTS3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
PTF1AQ7RTS3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
PTF1AQ7RTS3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
PTF1AQ7RTS3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
PTF1AQ7RTS3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
PTF1AQ7RTS3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms