Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
SMIM5Q71RC9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC33.58■■■□□ 2.97
SMIM5Q71RC9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SMIM5Q71RC9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
SMIM5Q71RC9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
SMIM5Q71RC9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
SMIM5Q71RC9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
SMIM5Q71RC9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
SMIM5Q71RC9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
SMIM5Q71RC9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SMIM5Q71RC9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SMIM5Q71RC9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
SMIM5Q71RC9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SMIM5Q71RC9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SMIM5Q71RC9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
SMIM5Q71RC9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
SMIM5Q71RC9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
SMIM5Q71RC9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
SMIM5Q71RC9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
SMIM5Q71RC9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.95
SMIM5Q71RC9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
SMIM5Q71RC9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
SMIM5Q71RC9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
SMIM5Q71RC9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
SMIM5Q71RC9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
SMIM5Q71RC9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
SMIM5Q71RC9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
SMIM5Q71RC9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
SMIM5Q71RC9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
SMIM5Q71RC9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
SMIM5Q71RC9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
SMIM5Q71RC9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
SMIM5Q71RC9 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SMIM5Q71RC9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
SMIM5Q71RC9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SMIM5Q71RC9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SMIM5Q71RC9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
SMIM5Q71RC9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
SMIM5Q71RC9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
SMIM5Q71RC9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC33.43■■■□□ 2.94
SMIM5Q71RC9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SMIM5Q71RC9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
SMIM5Q71RC9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
SMIM5Q71RC9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
SMIM5Q71RC9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
SMIM5Q71RC9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SMIM5Q71RC9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SMIM5Q71RC9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SMIM5Q71RC9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SMIM5Q71RC9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SMIM5Q71RC9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SMIM5Q71RC9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
SMIM5Q71RC9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
SMIM5Q71RC9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
SMIM5Q71RC9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
SMIM5Q71RC9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
SMIM5Q71RC9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
SMIM5Q71RC9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
SMIM5Q71RC9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SMIM5Q71RC9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SMIM5Q71RC9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SMIM5Q71RC9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
SMIM5Q71RC9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
SMIM5Q71RC9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SMIM5Q71RC9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SMIM5Q71RC9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SMIM5Q71RC9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
SMIM5Q71RC9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
SMIM5Q71RC9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SMIM5Q71RC9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SMIM5Q71RC9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
SMIM5Q71RC9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SMIM5Q71RC9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SMIM5Q71RC9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
SMIM5Q71RC9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
SMIM5Q71RC9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC33.29■■■□□ 2.92
SMIM5Q71RC9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
SMIM5Q71RC9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
SMIM5Q71RC9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
SMIM5Q71RC9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
SMIM5Q71RC9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
SMIM5Q71RC9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
SMIM5Q71RC9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
SMIM5Q71RC9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
SMIM5Q71RC9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
SMIM5Q71RC9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
SMIM5Q71RC9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
SMIM5Q71RC9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC33.24■■■□□ 2.91
SMIM5Q71RC9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
SMIM5Q71RC9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SMIM5Q71RC9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SMIM5Q71RC9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
SMIM5Q71RC9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
SMIM5Q71RC9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
SMIM5Q71RC9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
SMIM5Q71RC9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
SMIM5Q71RC9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SMIM5Q71RC9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SMIM5Q71RC9 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
SMIM5Q71RC9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms