Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SPOCD1Q6ZMY3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SPOCD1Q6ZMY3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SPOCD1Q6ZMY3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SPOCD1Q6ZMY3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SPOCD1Q6ZMY3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SPOCD1Q6ZMY3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SPOCD1Q6ZMY3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SPOCD1Q6ZMY3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SPOCD1Q6ZMY3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SPOCD1Q6ZMY3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SPOCD1Q6ZMY3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SPOCD1Q6ZMY3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SPOCD1Q6ZMY3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SPOCD1Q6ZMY3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SPOCD1Q6ZMY3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SPOCD1Q6ZMY3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SPOCD1Q6ZMY3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPOCD1Q6ZMY3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SPOCD1Q6ZMY3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPOCD1Q6ZMY3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPOCD1Q6ZMY3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPOCD1Q6ZMY3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SPOCD1Q6ZMY3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SPOCD1Q6ZMY3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SPOCD1Q6ZMY3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SPOCD1Q6ZMY3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SPOCD1Q6ZMY3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SPOCD1Q6ZMY3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SPOCD1Q6ZMY3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SPOCD1Q6ZMY3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SPOCD1Q6ZMY3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SPOCD1Q6ZMY3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SPOCD1Q6ZMY3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SPOCD1Q6ZMY3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SPOCD1Q6ZMY3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SPOCD1Q6ZMY3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SPOCD1Q6ZMY3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SPOCD1Q6ZMY3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SPOCD1Q6ZMY3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SPOCD1Q6ZMY3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SPOCD1Q6ZMY3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SPOCD1Q6ZMY3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SPOCD1Q6ZMY3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SPOCD1Q6ZMY3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SPOCD1Q6ZMY3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SPOCD1Q6ZMY3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SPOCD1Q6ZMY3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SPOCD1Q6ZMY3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SPOCD1Q6ZMY3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SPOCD1Q6ZMY3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SPOCD1Q6ZMY3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SPOCD1Q6ZMY3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SPOCD1Q6ZMY3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SPOCD1Q6ZMY3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SPOCD1Q6ZMY3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SPOCD1Q6ZMY3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SPOCD1Q6ZMY3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SPOCD1Q6ZMY3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SPOCD1Q6ZMY3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPOCD1Q6ZMY3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPOCD1Q6ZMY3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPOCD1Q6ZMY3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPOCD1Q6ZMY3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPOCD1Q6ZMY3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPOCD1Q6ZMY3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPOCD1Q6ZMY3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPOCD1Q6ZMY3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPOCD1Q6ZMY3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPOCD1Q6ZMY3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPOCD1Q6ZMY3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPOCD1Q6ZMY3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPOCD1Q6ZMY3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPOCD1Q6ZMY3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPOCD1Q6ZMY3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPOCD1Q6ZMY3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPOCD1Q6ZMY3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPOCD1Q6ZMY3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPOCD1Q6ZMY3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPOCD1Q6ZMY3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPOCD1Q6ZMY3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPOCD1Q6ZMY3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPOCD1Q6ZMY3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPOCD1Q6ZMY3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPOCD1Q6ZMY3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPOCD1Q6ZMY3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPOCD1Q6ZMY3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SPOCD1Q6ZMY3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SPOCD1Q6ZMY3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SPOCD1Q6ZMY3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SPOCD1Q6ZMY3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SPOCD1Q6ZMY3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SPOCD1Q6ZMY3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SPOCD1Q6ZMY3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SPOCD1Q6ZMY3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SPOCD1Q6ZMY3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SPOCD1Q6ZMY3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPOCD1Q6ZMY3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms