Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMP0

THSD4, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THSD4Q6ZMP0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
THSD4Q6ZMP0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
THSD4Q6ZMP0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
THSD4Q6ZMP0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
THSD4Q6ZMP0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
THSD4Q6ZMP0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
THSD4Q6ZMP0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
THSD4Q6ZMP0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
THSD4Q6ZMP0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
THSD4Q6ZMP0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
THSD4Q6ZMP0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
THSD4Q6ZMP0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
THSD4Q6ZMP0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
THSD4Q6ZMP0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
THSD4Q6ZMP0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
THSD4Q6ZMP0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
THSD4Q6ZMP0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
THSD4Q6ZMP0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
THSD4Q6ZMP0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
THSD4Q6ZMP0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
THSD4Q6ZMP0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
THSD4Q6ZMP0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
THSD4Q6ZMP0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
THSD4Q6ZMP0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
THSD4Q6ZMP0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
THSD4Q6ZMP0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
THSD4Q6ZMP0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
THSD4Q6ZMP0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
THSD4Q6ZMP0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
THSD4Q6ZMP0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
THSD4Q6ZMP0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
THSD4Q6ZMP0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
THSD4Q6ZMP0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
THSD4Q6ZMP0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
THSD4Q6ZMP0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
THSD4Q6ZMP0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
THSD4Q6ZMP0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
THSD4Q6ZMP0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
THSD4Q6ZMP0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
THSD4Q6ZMP0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
THSD4Q6ZMP0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
THSD4Q6ZMP0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
THSD4Q6ZMP0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
THSD4Q6ZMP0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
THSD4Q6ZMP0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
THSD4Q6ZMP0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
THSD4Q6ZMP0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
THSD4Q6ZMP0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
THSD4Q6ZMP0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
THSD4Q6ZMP0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
THSD4Q6ZMP0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
THSD4Q6ZMP0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
THSD4Q6ZMP0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
THSD4Q6ZMP0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
THSD4Q6ZMP0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
THSD4Q6ZMP0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
THSD4Q6ZMP0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
THSD4Q6ZMP0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
THSD4Q6ZMP0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
THSD4Q6ZMP0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
THSD4Q6ZMP0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
THSD4Q6ZMP0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
THSD4Q6ZMP0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
THSD4Q6ZMP0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
THSD4Q6ZMP0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
THSD4Q6ZMP0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
THSD4Q6ZMP0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
THSD4Q6ZMP0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
THSD4Q6ZMP0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
THSD4Q6ZMP0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
THSD4Q6ZMP0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
THSD4Q6ZMP0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
THSD4Q6ZMP0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
THSD4Q6ZMP0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
THSD4Q6ZMP0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
THSD4Q6ZMP0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
THSD4Q6ZMP0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
THSD4Q6ZMP0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
THSD4Q6ZMP0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
THSD4Q6ZMP0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
THSD4Q6ZMP0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
THSD4Q6ZMP0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
THSD4Q6ZMP0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
THSD4Q6ZMP0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
THSD4Q6ZMP0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
THSD4Q6ZMP0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
THSD4Q6ZMP0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
THSD4Q6ZMP0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
THSD4Q6ZMP0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
THSD4Q6ZMP0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
THSD4Q6ZMP0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
THSD4Q6ZMP0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
THSD4Q6ZMP0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
THSD4Q6ZMP0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
THSD4Q6ZMP0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
THSD4Q6ZMP0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
THSD4Q6ZMP0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
THSD4Q6ZMP0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
THSD4Q6ZMP0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
THSD4Q6ZMP0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms