Protein–RNA interactions for Protein: Q6YHK3

CD109, CD109 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD109Q6YHK3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
CD109Q6YHK3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC40.84■■■■■ 4.13
CD109Q6YHK3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC40.84■■■■■ 4.13
CD109Q6YHK3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC40.84■■■■■ 4.13
CD109Q6YHK3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
CD109Q6YHK3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
CD109Q6YHK3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
CD109Q6YHK3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC40.82■■■■■ 4.12
CD109Q6YHK3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
CD109Q6YHK3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
CD109Q6YHK3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
CD109Q6YHK3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC40.78■■■■■ 4.12
CD109Q6YHK3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
CD109Q6YHK3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
CD109Q6YHK3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC40.76■■■■■ 4.11
CD109Q6YHK3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC40.75■■■■■ 4.11
CD109Q6YHK3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC40.75■■■■■ 4.11
CD109Q6YHK3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC40.75■■■■■ 4.11
CD109Q6YHK3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
CD109Q6YHK3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC40.74■■■■■ 4.11
CD109Q6YHK3 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
CD109Q6YHK3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC40.72■■■■■ 4.11
CD109Q6YHK3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
CD109Q6YHK3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC40.72■■■■■ 4.11
CD109Q6YHK3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC40.67■■■■■ 4.1
CD109Q6YHK3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.67■■■■■ 4.1
CD109Q6YHK3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
CD109Q6YHK3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC40.66■■■■■ 4.1
CD109Q6YHK3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.66■■■■■ 4.1
CD109Q6YHK3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC40.64■■■■■ 4.1
CD109Q6YHK3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC40.63■■■■■ 4.09
CD109Q6YHK3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
CD109Q6YHK3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.62■■■■■ 4.09
CD109Q6YHK3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
CD109Q6YHK3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC40.61■■■■■ 4.09
CD109Q6YHK3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC40.61■■■■■ 4.09
CD109Q6YHK3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC40.61■■■■■ 4.09
CD109Q6YHK3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC40.6■■■■■ 4.09
CD109Q6YHK3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
CD109Q6YHK3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
CD109Q6YHK3 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.58■■■■■ 4.09
CD109Q6YHK3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.09
CD109Q6YHK3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC40.57■■■■■ 4.08
CD109Q6YHK3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.08
CD109Q6YHK3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.08
CD109Q6YHK3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC40.56■■■■■ 4.08
CD109Q6YHK3 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC40.55■■■■■ 4.08
CD109Q6YHK3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
CD109Q6YHK3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
CD109Q6YHK3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
CD109Q6YHK3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
CD109Q6YHK3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC40.5■■■■■ 4.07
CD109Q6YHK3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC40.49■■■■■ 4.07
CD109Q6YHK3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
CD109Q6YHK3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC40.48■■■■■ 4.07
CD109Q6YHK3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC40.48■■■■■ 4.07
CD109Q6YHK3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
CD109Q6YHK3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
CD109Q6YHK3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC40.45■■■■■ 4.07
CD109Q6YHK3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.44■■■■■ 4.06
CD109Q6YHK3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
CD109Q6YHK3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC40.43■■■■■ 4.06
CD109Q6YHK3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
CD109Q6YHK3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC40.43■■■■■ 4.06
CD109Q6YHK3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
CD109Q6YHK3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC40.42■■■■■ 4.06
CD109Q6YHK3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC40.42■■■■■ 4.06
CD109Q6YHK3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC40.42■■■■■ 4.06
CD109Q6YHK3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC40.41■■■■■ 4.06
CD109Q6YHK3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC40.4■■■■■ 4.06
CD109Q6YHK3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC40.4■■■■■ 4.06
CD109Q6YHK3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
CD109Q6YHK3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
CD109Q6YHK3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.39■■■■■ 4.06
CD109Q6YHK3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
CD109Q6YHK3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
CD109Q6YHK3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
CD109Q6YHK3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC40.38■■■■■ 4.05
CD109Q6YHK3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC40.38■■■■■ 4.05
CD109Q6YHK3 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.38■■■■■ 4.05
CD109Q6YHK3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.37■■■■■ 4.05
CD109Q6YHK3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC40.36■■■■■ 4.05
CD109Q6YHK3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
CD109Q6YHK3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC40.34■■■■■ 4.05
CD109Q6YHK3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
CD109Q6YHK3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
CD109Q6YHK3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC40.33■■■■■ 4.05
CD109Q6YHK3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
CD109Q6YHK3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
CD109Q6YHK3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC40.32■■■■■ 4.04
CD109Q6YHK3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
CD109Q6YHK3 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
CD109Q6YHK3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC40.3■■■■■ 4.04
CD109Q6YHK3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC40.3■■■■■ 4.04
CD109Q6YHK3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
CD109Q6YHK3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
CD109Q6YHK3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
CD109Q6YHK3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
CD109Q6YHK3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
CD109Q6YHK3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.25■■■■■ 4.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms