Protein–RNA interactions for Protein: Q6W4X9

MUC6, Mucin-6, humanhuman

Predictions only

Length 2,439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC6Q6W4X9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
MUC6Q6W4X9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MUC6Q6W4X9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MUC6Q6W4X9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MUC6Q6W4X9 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MUC6Q6W4X9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MUC6Q6W4X9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MUC6Q6W4X9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MUC6Q6W4X9 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MUC6Q6W4X9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MUC6Q6W4X9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MUC6Q6W4X9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
MUC6Q6W4X9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
MUC6Q6W4X9 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
MUC6Q6W4X9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
MUC6Q6W4X9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MUC6Q6W4X9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MUC6Q6W4X9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MUC6Q6W4X9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MUC6Q6W4X9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MUC6Q6W4X9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MUC6Q6W4X9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MUC6Q6W4X9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MUC6Q6W4X9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MUC6Q6W4X9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MUC6Q6W4X9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MUC6Q6W4X9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MUC6Q6W4X9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MUC6Q6W4X9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MUC6Q6W4X9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MUC6Q6W4X9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MUC6Q6W4X9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MUC6Q6W4X9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MUC6Q6W4X9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MUC6Q6W4X9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MUC6Q6W4X9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MUC6Q6W4X9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MUC6Q6W4X9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
MUC6Q6W4X9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MUC6Q6W4X9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MUC6Q6W4X9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MUC6Q6W4X9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MUC6Q6W4X9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MUC6Q6W4X9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MUC6Q6W4X9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MUC6Q6W4X9 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MUC6Q6W4X9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MUC6Q6W4X9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MUC6Q6W4X9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MUC6Q6W4X9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MUC6Q6W4X9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MUC6Q6W4X9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MUC6Q6W4X9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MUC6Q6W4X9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MUC6Q6W4X9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
MUC6Q6W4X9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MUC6Q6W4X9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MUC6Q6W4X9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MUC6Q6W4X9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MUC6Q6W4X9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
MUC6Q6W4X9 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
MUC6Q6W4X9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MUC6Q6W4X9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MUC6Q6W4X9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MUC6Q6W4X9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
MUC6Q6W4X9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MUC6Q6W4X9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MUC6Q6W4X9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MUC6Q6W4X9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MUC6Q6W4X9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MUC6Q6W4X9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MUC6Q6W4X9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MUC6Q6W4X9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MUC6Q6W4X9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MUC6Q6W4X9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
MUC6Q6W4X9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
MUC6Q6W4X9 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MUC6Q6W4X9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MUC6Q6W4X9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MUC6Q6W4X9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MUC6Q6W4X9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MUC6Q6W4X9 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MUC6Q6W4X9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MUC6Q6W4X9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MUC6Q6W4X9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MUC6Q6W4X9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
MUC6Q6W4X9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
MUC6Q6W4X9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MUC6Q6W4X9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
MUC6Q6W4X9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MUC6Q6W4X9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
MUC6Q6W4X9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MUC6Q6W4X9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MUC6Q6W4X9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MUC6Q6W4X9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MUC6Q6W4X9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MUC6Q6W4X9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MUC6Q6W4X9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MUC6Q6W4X9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
MUC6Q6W4X9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms