Protein–RNA interactions for Protein: Q6VVB1

NHLRC1, E3 ubiquitin-protein ligase NHLRC1, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC1Q6VVB1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NHLRC1Q6VVB1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NHLRC1Q6VVB1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NHLRC1Q6VVB1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NHLRC1Q6VVB1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NHLRC1Q6VVB1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NHLRC1Q6VVB1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NHLRC1Q6VVB1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NHLRC1Q6VVB1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NHLRC1Q6VVB1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NHLRC1Q6VVB1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NHLRC1Q6VVB1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NHLRC1Q6VVB1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NHLRC1Q6VVB1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NHLRC1Q6VVB1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NHLRC1Q6VVB1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NHLRC1Q6VVB1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NHLRC1Q6VVB1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NHLRC1Q6VVB1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NHLRC1Q6VVB1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NHLRC1Q6VVB1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NHLRC1Q6VVB1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NHLRC1Q6VVB1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NHLRC1Q6VVB1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NHLRC1Q6VVB1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NHLRC1Q6VVB1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NHLRC1Q6VVB1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NHLRC1Q6VVB1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NHLRC1Q6VVB1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NHLRC1Q6VVB1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NHLRC1Q6VVB1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NHLRC1Q6VVB1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NHLRC1Q6VVB1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NHLRC1Q6VVB1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NHLRC1Q6VVB1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NHLRC1Q6VVB1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NHLRC1Q6VVB1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NHLRC1Q6VVB1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NHLRC1Q6VVB1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NHLRC1Q6VVB1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NHLRC1Q6VVB1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NHLRC1Q6VVB1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NHLRC1Q6VVB1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NHLRC1Q6VVB1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NHLRC1Q6VVB1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NHLRC1Q6VVB1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NHLRC1Q6VVB1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NHLRC1Q6VVB1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NHLRC1Q6VVB1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NHLRC1Q6VVB1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NHLRC1Q6VVB1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NHLRC1Q6VVB1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NHLRC1Q6VVB1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NHLRC1Q6VVB1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NHLRC1Q6VVB1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NHLRC1Q6VVB1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NHLRC1Q6VVB1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NHLRC1Q6VVB1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NHLRC1Q6VVB1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NHLRC1Q6VVB1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NHLRC1Q6VVB1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NHLRC1Q6VVB1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NHLRC1Q6VVB1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NHLRC1Q6VVB1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NHLRC1Q6VVB1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NHLRC1Q6VVB1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NHLRC1Q6VVB1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NHLRC1Q6VVB1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NHLRC1Q6VVB1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NHLRC1Q6VVB1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NHLRC1Q6VVB1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NHLRC1Q6VVB1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NHLRC1Q6VVB1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NHLRC1Q6VVB1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NHLRC1Q6VVB1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NHLRC1Q6VVB1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NHLRC1Q6VVB1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NHLRC1Q6VVB1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NHLRC1Q6VVB1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NHLRC1Q6VVB1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NHLRC1Q6VVB1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NHLRC1Q6VVB1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NHLRC1Q6VVB1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NHLRC1Q6VVB1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NHLRC1Q6VVB1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NHLRC1Q6VVB1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NHLRC1Q6VVB1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NHLRC1Q6VVB1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NHLRC1Q6VVB1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NHLRC1Q6VVB1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NHLRC1Q6VVB1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NHLRC1Q6VVB1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NHLRC1Q6VVB1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NHLRC1Q6VVB1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NHLRC1Q6VVB1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NHLRC1Q6VVB1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NHLRC1Q6VVB1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NHLRC1Q6VVB1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NHLRC1Q6VVB1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NHLRC1Q6VVB1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms