Protein–RNA interactions for Protein: Q6VUC0

TFAP2E, Transcription factor AP-2-epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAP2EQ6VUC0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TFAP2EQ6VUC0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TFAP2EQ6VUC0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TFAP2EQ6VUC0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TFAP2EQ6VUC0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TFAP2EQ6VUC0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TFAP2EQ6VUC0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TFAP2EQ6VUC0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TFAP2EQ6VUC0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TFAP2EQ6VUC0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TFAP2EQ6VUC0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TFAP2EQ6VUC0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TFAP2EQ6VUC0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TFAP2EQ6VUC0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TFAP2EQ6VUC0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TFAP2EQ6VUC0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TFAP2EQ6VUC0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TFAP2EQ6VUC0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TFAP2EQ6VUC0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TFAP2EQ6VUC0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TFAP2EQ6VUC0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TFAP2EQ6VUC0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TFAP2EQ6VUC0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TFAP2EQ6VUC0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TFAP2EQ6VUC0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TFAP2EQ6VUC0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TFAP2EQ6VUC0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TFAP2EQ6VUC0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TFAP2EQ6VUC0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TFAP2EQ6VUC0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TFAP2EQ6VUC0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TFAP2EQ6VUC0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TFAP2EQ6VUC0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TFAP2EQ6VUC0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TFAP2EQ6VUC0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TFAP2EQ6VUC0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TFAP2EQ6VUC0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TFAP2EQ6VUC0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TFAP2EQ6VUC0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TFAP2EQ6VUC0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TFAP2EQ6VUC0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TFAP2EQ6VUC0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TFAP2EQ6VUC0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TFAP2EQ6VUC0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TFAP2EQ6VUC0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TFAP2EQ6VUC0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TFAP2EQ6VUC0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TFAP2EQ6VUC0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TFAP2EQ6VUC0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TFAP2EQ6VUC0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TFAP2EQ6VUC0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TFAP2EQ6VUC0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TFAP2EQ6VUC0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TFAP2EQ6VUC0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TFAP2EQ6VUC0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TFAP2EQ6VUC0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TFAP2EQ6VUC0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TFAP2EQ6VUC0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TFAP2EQ6VUC0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TFAP2EQ6VUC0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TFAP2EQ6VUC0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TFAP2EQ6VUC0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TFAP2EQ6VUC0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TFAP2EQ6VUC0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TFAP2EQ6VUC0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TFAP2EQ6VUC0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TFAP2EQ6VUC0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TFAP2EQ6VUC0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TFAP2EQ6VUC0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TFAP2EQ6VUC0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TFAP2EQ6VUC0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TFAP2EQ6VUC0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TFAP2EQ6VUC0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TFAP2EQ6VUC0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TFAP2EQ6VUC0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TFAP2EQ6VUC0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TFAP2EQ6VUC0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TFAP2EQ6VUC0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TFAP2EQ6VUC0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TFAP2EQ6VUC0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TFAP2EQ6VUC0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TFAP2EQ6VUC0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TFAP2EQ6VUC0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TFAP2EQ6VUC0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TFAP2EQ6VUC0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TFAP2EQ6VUC0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TFAP2EQ6VUC0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TFAP2EQ6VUC0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TFAP2EQ6VUC0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TFAP2EQ6VUC0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TFAP2EQ6VUC0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TFAP2EQ6VUC0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TFAP2EQ6VUC0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TFAP2EQ6VUC0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TFAP2EQ6VUC0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TFAP2EQ6VUC0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TFAP2EQ6VUC0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TFAP2EQ6VUC0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TFAP2EQ6VUC0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TFAP2EQ6VUC0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.1 ms