Protein–RNA interactions for Protein: Q6UVM3

KCNT2, Potassium channel subfamily T member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT2Q6UVM3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
KCNT2Q6UVM3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KCNT2Q6UVM3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KCNT2Q6UVM3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KCNT2Q6UVM3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KCNT2Q6UVM3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KCNT2Q6UVM3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KCNT2Q6UVM3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KCNT2Q6UVM3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KCNT2Q6UVM3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KCNT2Q6UVM3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KCNT2Q6UVM3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
KCNT2Q6UVM3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KCNT2Q6UVM3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KCNT2Q6UVM3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KCNT2Q6UVM3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KCNT2Q6UVM3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KCNT2Q6UVM3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
KCNT2Q6UVM3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
KCNT2Q6UVM3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KCNT2Q6UVM3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KCNT2Q6UVM3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KCNT2Q6UVM3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KCNT2Q6UVM3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KCNT2Q6UVM3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KCNT2Q6UVM3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KCNT2Q6UVM3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KCNT2Q6UVM3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KCNT2Q6UVM3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KCNT2Q6UVM3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
KCNT2Q6UVM3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
KCNT2Q6UVM3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KCNT2Q6UVM3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KCNT2Q6UVM3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KCNT2Q6UVM3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KCNT2Q6UVM3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KCNT2Q6UVM3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KCNT2Q6UVM3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
KCNT2Q6UVM3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KCNT2Q6UVM3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KCNT2Q6UVM3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KCNT2Q6UVM3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KCNT2Q6UVM3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KCNT2Q6UVM3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
KCNT2Q6UVM3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KCNT2Q6UVM3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KCNT2Q6UVM3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KCNT2Q6UVM3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KCNT2Q6UVM3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KCNT2Q6UVM3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KCNT2Q6UVM3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KCNT2Q6UVM3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KCNT2Q6UVM3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KCNT2Q6UVM3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KCNT2Q6UVM3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KCNT2Q6UVM3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KCNT2Q6UVM3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KCNT2Q6UVM3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KCNT2Q6UVM3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KCNT2Q6UVM3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KCNT2Q6UVM3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KCNT2Q6UVM3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KCNT2Q6UVM3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KCNT2Q6UVM3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KCNT2Q6UVM3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KCNT2Q6UVM3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KCNT2Q6UVM3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KCNT2Q6UVM3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KCNT2Q6UVM3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KCNT2Q6UVM3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KCNT2Q6UVM3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KCNT2Q6UVM3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KCNT2Q6UVM3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KCNT2Q6UVM3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KCNT2Q6UVM3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KCNT2Q6UVM3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KCNT2Q6UVM3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KCNT2Q6UVM3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KCNT2Q6UVM3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KCNT2Q6UVM3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KCNT2Q6UVM3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KCNT2Q6UVM3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KCNT2Q6UVM3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KCNT2Q6UVM3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KCNT2Q6UVM3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
KCNT2Q6UVM3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KCNT2Q6UVM3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KCNT2Q6UVM3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KCNT2Q6UVM3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KCNT2Q6UVM3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KCNT2Q6UVM3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KCNT2Q6UVM3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KCNT2Q6UVM3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KCNT2Q6UVM3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KCNT2Q6UVM3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KCNT2Q6UVM3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
KCNT2Q6UVM3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KCNT2Q6UVM3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
KCNT2Q6UVM3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KCNT2Q6UVM3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms