Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIZ9

TRAT1, T-cell receptor-associated transmembrane adapter 1, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAT1Q6PIZ9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAT1Q6PIZ9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAT1Q6PIZ9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAT1Q6PIZ9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAT1Q6PIZ9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAT1Q6PIZ9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TRAT1Q6PIZ9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAT1Q6PIZ9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAT1Q6PIZ9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAT1Q6PIZ9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAT1Q6PIZ9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAT1Q6PIZ9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAT1Q6PIZ9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAT1Q6PIZ9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAT1Q6PIZ9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAT1Q6PIZ9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAT1Q6PIZ9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAT1Q6PIZ9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAT1Q6PIZ9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAT1Q6PIZ9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAT1Q6PIZ9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAT1Q6PIZ9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAT1Q6PIZ9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAT1Q6PIZ9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAT1Q6PIZ9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAT1Q6PIZ9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAT1Q6PIZ9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAT1Q6PIZ9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAT1Q6PIZ9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAT1Q6PIZ9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAT1Q6PIZ9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAT1Q6PIZ9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAT1Q6PIZ9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAT1Q6PIZ9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAT1Q6PIZ9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
TRAT1Q6PIZ9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRAT1Q6PIZ9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAT1Q6PIZ9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAT1Q6PIZ9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAT1Q6PIZ9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAT1Q6PIZ9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAT1Q6PIZ9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAT1Q6PIZ9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAT1Q6PIZ9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAT1Q6PIZ9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAT1Q6PIZ9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAT1Q6PIZ9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAT1Q6PIZ9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAT1Q6PIZ9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAT1Q6PIZ9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAT1Q6PIZ9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAT1Q6PIZ9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAT1Q6PIZ9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAT1Q6PIZ9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAT1Q6PIZ9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAT1Q6PIZ9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAT1Q6PIZ9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAT1Q6PIZ9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAT1Q6PIZ9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAT1Q6PIZ9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAT1Q6PIZ9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAT1Q6PIZ9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAT1Q6PIZ9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAT1Q6PIZ9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAT1Q6PIZ9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAT1Q6PIZ9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAT1Q6PIZ9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAT1Q6PIZ9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAT1Q6PIZ9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAT1Q6PIZ9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRAT1Q6PIZ9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAT1Q6PIZ9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRAT1Q6PIZ9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAT1Q6PIZ9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRAT1Q6PIZ9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAT1Q6PIZ9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TRAT1Q6PIZ9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TRAT1Q6PIZ9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAT1Q6PIZ9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAT1Q6PIZ9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAT1Q6PIZ9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAT1Q6PIZ9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAT1Q6PIZ9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAT1Q6PIZ9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAT1Q6PIZ9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRAT1Q6PIZ9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAT1Q6PIZ9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TRAT1Q6PIZ9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAT1Q6PIZ9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAT1Q6PIZ9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAT1Q6PIZ9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRAT1Q6PIZ9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAT1Q6PIZ9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAT1Q6PIZ9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRAT1Q6PIZ9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRAT1Q6PIZ9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAT1Q6PIZ9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAT1Q6PIZ9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAT1Q6PIZ9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAT1Q6PIZ9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms