Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Q4

LMOD2, Leiomodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD2Q6P5Q4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
LMOD2Q6P5Q4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
LMOD2Q6P5Q4 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
LMOD2Q6P5Q4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
LMOD2Q6P5Q4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
LMOD2Q6P5Q4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
LMOD2Q6P5Q4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
LMOD2Q6P5Q4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
LMOD2Q6P5Q4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
LMOD2Q6P5Q4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
LMOD2Q6P5Q4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC35.89■■■■□ 3.34
LMOD2Q6P5Q4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
LMOD2Q6P5Q4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
LMOD2Q6P5Q4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
LMOD2Q6P5Q4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
LMOD2Q6P5Q4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
LMOD2Q6P5Q4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
LMOD2Q6P5Q4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
LMOD2Q6P5Q4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
LMOD2Q6P5Q4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
LMOD2Q6P5Q4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
LMOD2Q6P5Q4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
LMOD2Q6P5Q4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
LMOD2Q6P5Q4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
LMOD2Q6P5Q4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
LMOD2Q6P5Q4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
LMOD2Q6P5Q4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
LMOD2Q6P5Q4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
LMOD2Q6P5Q4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
LMOD2Q6P5Q4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
LMOD2Q6P5Q4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC35.8■■■■□ 3.32
LMOD2Q6P5Q4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
LMOD2Q6P5Q4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
LMOD2Q6P5Q4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
LMOD2Q6P5Q4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC35.77■■■■□ 3.32
LMOD2Q6P5Q4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
LMOD2Q6P5Q4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
LMOD2Q6P5Q4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
LMOD2Q6P5Q4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
LMOD2Q6P5Q4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
LMOD2Q6P5Q4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
LMOD2Q6P5Q4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
LMOD2Q6P5Q4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
LMOD2Q6P5Q4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
LMOD2Q6P5Q4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
LMOD2Q6P5Q4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
LMOD2Q6P5Q4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.72■■■■□ 3.31
LMOD2Q6P5Q4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
LMOD2Q6P5Q4 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
LMOD2Q6P5Q4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
LMOD2Q6P5Q4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
LMOD2Q6P5Q4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
LMOD2Q6P5Q4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
LMOD2Q6P5Q4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
LMOD2Q6P5Q4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
LMOD2Q6P5Q4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC35.67■■■■□ 3.3
LMOD2Q6P5Q4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
LMOD2Q6P5Q4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
LMOD2Q6P5Q4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
LMOD2Q6P5Q4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC35.66■■■■□ 3.3
LMOD2Q6P5Q4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
LMOD2Q6P5Q4 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC35.64■■■■□ 3.3
LMOD2Q6P5Q4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
LMOD2Q6P5Q4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
LMOD2Q6P5Q4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.63■■■■□ 3.29
LMOD2Q6P5Q4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
LMOD2Q6P5Q4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
LMOD2Q6P5Q4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
LMOD2Q6P5Q4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
LMOD2Q6P5Q4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
LMOD2Q6P5Q4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
LMOD2Q6P5Q4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
LMOD2Q6P5Q4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
LMOD2Q6P5Q4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
LMOD2Q6P5Q4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
LMOD2Q6P5Q4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
LMOD2Q6P5Q4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
LMOD2Q6P5Q4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
LMOD2Q6P5Q4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.29
LMOD2Q6P5Q4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC35.57■■■■□ 3.29
LMOD2Q6P5Q4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
LMOD2Q6P5Q4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
LMOD2Q6P5Q4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC35.57■■■■□ 3.28
LMOD2Q6P5Q4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
LMOD2Q6P5Q4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
LMOD2Q6P5Q4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
LMOD2Q6P5Q4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
LMOD2Q6P5Q4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
LMOD2Q6P5Q4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
LMOD2Q6P5Q4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.54■■■■□ 3.28
LMOD2Q6P5Q4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
LMOD2Q6P5Q4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
LMOD2Q6P5Q4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
LMOD2Q6P5Q4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
LMOD2Q6P5Q4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
LMOD2Q6P5Q4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
LMOD2Q6P5Q4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
LMOD2Q6P5Q4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
LMOD2Q6P5Q4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
LMOD2Q6P5Q4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms