Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZY4

ZCCHC8, Zinc finger CCHC domain-containing protein 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC8Q6NZY4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZCCHC8Q6NZY4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZCCHC8Q6NZY4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZCCHC8Q6NZY4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZCCHC8Q6NZY4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZCCHC8Q6NZY4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZCCHC8Q6NZY4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZCCHC8Q6NZY4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZCCHC8Q6NZY4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZCCHC8Q6NZY4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZCCHC8Q6NZY4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZCCHC8Q6NZY4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZCCHC8Q6NZY4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZCCHC8Q6NZY4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZCCHC8Q6NZY4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ZCCHC8Q6NZY4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ZCCHC8Q6NZY4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ZCCHC8Q6NZY4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ZCCHC8Q6NZY4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ZCCHC8Q6NZY4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ZCCHC8Q6NZY4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ZCCHC8Q6NZY4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ZCCHC8Q6NZY4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ZCCHC8Q6NZY4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZCCHC8Q6NZY4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZCCHC8Q6NZY4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZCCHC8Q6NZY4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZCCHC8Q6NZY4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZCCHC8Q6NZY4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZCCHC8Q6NZY4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZCCHC8Q6NZY4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ZCCHC8Q6NZY4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZCCHC8Q6NZY4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZCCHC8Q6NZY4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZCCHC8Q6NZY4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZCCHC8Q6NZY4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZCCHC8Q6NZY4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZCCHC8Q6NZY4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZCCHC8Q6NZY4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZCCHC8Q6NZY4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZCCHC8Q6NZY4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZCCHC8Q6NZY4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ZCCHC8Q6NZY4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZCCHC8Q6NZY4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZCCHC8Q6NZY4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZCCHC8Q6NZY4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZCCHC8Q6NZY4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZCCHC8Q6NZY4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZCCHC8Q6NZY4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZCCHC8Q6NZY4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ZCCHC8Q6NZY4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZCCHC8Q6NZY4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZCCHC8Q6NZY4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZCCHC8Q6NZY4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZCCHC8Q6NZY4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZCCHC8Q6NZY4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZCCHC8Q6NZY4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZCCHC8Q6NZY4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZCCHC8Q6NZY4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZCCHC8Q6NZY4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZCCHC8Q6NZY4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZCCHC8Q6NZY4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZCCHC8Q6NZY4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZCCHC8Q6NZY4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZCCHC8Q6NZY4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZCCHC8Q6NZY4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZCCHC8Q6NZY4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZCCHC8Q6NZY4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZCCHC8Q6NZY4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZCCHC8Q6NZY4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZCCHC8Q6NZY4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZCCHC8Q6NZY4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZCCHC8Q6NZY4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ZCCHC8Q6NZY4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZCCHC8Q6NZY4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ZCCHC8Q6NZY4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZCCHC8Q6NZY4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZCCHC8Q6NZY4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZCCHC8Q6NZY4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZCCHC8Q6NZY4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZCCHC8Q6NZY4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZCCHC8Q6NZY4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZCCHC8Q6NZY4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZCCHC8Q6NZY4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZCCHC8Q6NZY4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZCCHC8Q6NZY4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZCCHC8Q6NZY4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZCCHC8Q6NZY4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZCCHC8Q6NZY4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZCCHC8Q6NZY4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZCCHC8Q6NZY4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZCCHC8Q6NZY4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ZCCHC8Q6NZY4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZCCHC8Q6NZY4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZCCHC8Q6NZY4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZCCHC8Q6NZY4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZCCHC8Q6NZY4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZCCHC8Q6NZY4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZCCHC8Q6NZY4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ZCCHC8Q6NZY4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms