Protein–RNA interactions for Protein: Q6NX49

ZNF544, Zinc finger protein 544, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF544Q6NX49 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF544Q6NX49 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF544Q6NX49 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF544Q6NX49 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF544Q6NX49 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF544Q6NX49 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF544Q6NX49 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF544Q6NX49 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF544Q6NX49 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF544Q6NX49 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF544Q6NX49 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF544Q6NX49 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF544Q6NX49 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF544Q6NX49 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF544Q6NX49 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF544Q6NX49 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF544Q6NX49 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF544Q6NX49 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF544Q6NX49 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF544Q6NX49 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF544Q6NX49 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF544Q6NX49 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF544Q6NX49 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF544Q6NX49 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF544Q6NX49 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF544Q6NX49 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF544Q6NX49 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF544Q6NX49 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF544Q6NX49 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF544Q6NX49 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF544Q6NX49 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF544Q6NX49 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF544Q6NX49 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF544Q6NX49 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF544Q6NX49 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF544Q6NX49 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF544Q6NX49 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF544Q6NX49 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF544Q6NX49 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF544Q6NX49 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF544Q6NX49 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF544Q6NX49 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF544Q6NX49 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF544Q6NX49 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF544Q6NX49 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF544Q6NX49 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF544Q6NX49 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF544Q6NX49 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF544Q6NX49 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF544Q6NX49 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF544Q6NX49 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF544Q6NX49 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF544Q6NX49 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF544Q6NX49 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF544Q6NX49 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF544Q6NX49 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF544Q6NX49 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF544Q6NX49 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF544Q6NX49 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF544Q6NX49 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF544Q6NX49 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF544Q6NX49 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF544Q6NX49 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF544Q6NX49 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF544Q6NX49 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF544Q6NX49 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF544Q6NX49 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF544Q6NX49 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF544Q6NX49 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF544Q6NX49 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF544Q6NX49 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF544Q6NX49 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF544Q6NX49 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF544Q6NX49 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF544Q6NX49 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF544Q6NX49 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF544Q6NX49 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF544Q6NX49 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF544Q6NX49 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF544Q6NX49 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF544Q6NX49 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF544Q6NX49 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF544Q6NX49 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF544Q6NX49 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF544Q6NX49 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF544Q6NX49 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF544Q6NX49 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF544Q6NX49 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF544Q6NX49 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF544Q6NX49 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF544Q6NX49 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF544Q6NX49 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF544Q6NX49 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF544Q6NX49 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF544Q6NX49 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF544Q6NX49 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF544Q6NX49 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF544Q6NX49 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF544Q6NX49 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF544Q6NX49 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 754.7 ms