Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUP7

PPP4R4, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R4Q6NUP7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PPP4R4Q6NUP7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPP4R4Q6NUP7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPP4R4Q6NUP7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPP4R4Q6NUP7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPP4R4Q6NUP7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPP4R4Q6NUP7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPP4R4Q6NUP7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPP4R4Q6NUP7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPP4R4Q6NUP7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPP4R4Q6NUP7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPP4R4Q6NUP7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPP4R4Q6NUP7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPP4R4Q6NUP7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PPP4R4Q6NUP7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PPP4R4Q6NUP7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPP4R4Q6NUP7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPP4R4Q6NUP7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPP4R4Q6NUP7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPP4R4Q6NUP7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPP4R4Q6NUP7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPP4R4Q6NUP7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPP4R4Q6NUP7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPP4R4Q6NUP7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPP4R4Q6NUP7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPP4R4Q6NUP7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPP4R4Q6NUP7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPP4R4Q6NUP7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPP4R4Q6NUP7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPP4R4Q6NUP7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPP4R4Q6NUP7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPP4R4Q6NUP7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPP4R4Q6NUP7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPP4R4Q6NUP7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPP4R4Q6NUP7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPP4R4Q6NUP7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPP4R4Q6NUP7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPP4R4Q6NUP7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPP4R4Q6NUP7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPP4R4Q6NUP7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPP4R4Q6NUP7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPP4R4Q6NUP7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPP4R4Q6NUP7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPP4R4Q6NUP7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPP4R4Q6NUP7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPP4R4Q6NUP7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPP4R4Q6NUP7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPP4R4Q6NUP7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPP4R4Q6NUP7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPP4R4Q6NUP7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PPP4R4Q6NUP7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PPP4R4Q6NUP7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PPP4R4Q6NUP7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPP4R4Q6NUP7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPP4R4Q6NUP7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPP4R4Q6NUP7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PPP4R4Q6NUP7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPP4R4Q6NUP7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPP4R4Q6NUP7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPP4R4Q6NUP7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPP4R4Q6NUP7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPP4R4Q6NUP7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPP4R4Q6NUP7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPP4R4Q6NUP7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPP4R4Q6NUP7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPP4R4Q6NUP7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPP4R4Q6NUP7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPP4R4Q6NUP7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPP4R4Q6NUP7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPP4R4Q6NUP7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPP4R4Q6NUP7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPP4R4Q6NUP7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPP4R4Q6NUP7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPP4R4Q6NUP7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PPP4R4Q6NUP7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PPP4R4Q6NUP7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PPP4R4Q6NUP7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PPP4R4Q6NUP7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPP4R4Q6NUP7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPP4R4Q6NUP7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPP4R4Q6NUP7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPP4R4Q6NUP7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPP4R4Q6NUP7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPP4R4Q6NUP7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPP4R4Q6NUP7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPP4R4Q6NUP7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPP4R4Q6NUP7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPP4R4Q6NUP7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPP4R4Q6NUP7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPP4R4Q6NUP7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPP4R4Q6NUP7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PPP4R4Q6NUP7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPP4R4Q6NUP7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPP4R4Q6NUP7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPP4R4Q6NUP7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPP4R4Q6NUP7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPP4R4Q6NUP7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPP4R4Q6NUP7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPP4R4Q6NUP7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPP4R4Q6NUP7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms