Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSX1

CCDC70, Coiled-coil domain-containing protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC70Q6NSX1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC70Q6NSX1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC70Q6NSX1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC70Q6NSX1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC70Q6NSX1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC70Q6NSX1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC70Q6NSX1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC70Q6NSX1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC70Q6NSX1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC70Q6NSX1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC70Q6NSX1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC70Q6NSX1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC70Q6NSX1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC70Q6NSX1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC70Q6NSX1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC70Q6NSX1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC70Q6NSX1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC70Q6NSX1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC70Q6NSX1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC70Q6NSX1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC70Q6NSX1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC70Q6NSX1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC70Q6NSX1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC70Q6NSX1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC70Q6NSX1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC70Q6NSX1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC70Q6NSX1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC70Q6NSX1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC70Q6NSX1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC70Q6NSX1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC70Q6NSX1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC70Q6NSX1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC70Q6NSX1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC70Q6NSX1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC70Q6NSX1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC70Q6NSX1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC70Q6NSX1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC70Q6NSX1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC70Q6NSX1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC70Q6NSX1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC70Q6NSX1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC70Q6NSX1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC70Q6NSX1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC70Q6NSX1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC70Q6NSX1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC70Q6NSX1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC70Q6NSX1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC70Q6NSX1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC70Q6NSX1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC70Q6NSX1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC70Q6NSX1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC70Q6NSX1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC70Q6NSX1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC70Q6NSX1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC70Q6NSX1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC70Q6NSX1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC70Q6NSX1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC70Q6NSX1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC70Q6NSX1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC70Q6NSX1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC70Q6NSX1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC70Q6NSX1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC70Q6NSX1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC70Q6NSX1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC70Q6NSX1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC70Q6NSX1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC70Q6NSX1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC70Q6NSX1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC70Q6NSX1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC70Q6NSX1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC70Q6NSX1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC70Q6NSX1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC70Q6NSX1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC70Q6NSX1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC70Q6NSX1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC70Q6NSX1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC70Q6NSX1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC70Q6NSX1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC70Q6NSX1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC70Q6NSX1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC70Q6NSX1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC70Q6NSX1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC70Q6NSX1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCDC70Q6NSX1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCDC70Q6NSX1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC70Q6NSX1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC70Q6NSX1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC70Q6NSX1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC70Q6NSX1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC70Q6NSX1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC70Q6NSX1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC70Q6NSX1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC70Q6NSX1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC70Q6NSX1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC70Q6NSX1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC70Q6NSX1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC70Q6NSX1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC70Q6NSX1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC70Q6NSX1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC70Q6NSX1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms