Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSX1

CCDC70, Coiled-coil domain-containing protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC70Q6NSX1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC70Q6NSX1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC70Q6NSX1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC70Q6NSX1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC70Q6NSX1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC70Q6NSX1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC70Q6NSX1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC70Q6NSX1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC70Q6NSX1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC70Q6NSX1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC70Q6NSX1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC70Q6NSX1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC70Q6NSX1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC70Q6NSX1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC70Q6NSX1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC70Q6NSX1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC70Q6NSX1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC70Q6NSX1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC70Q6NSX1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC70Q6NSX1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC70Q6NSX1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC70Q6NSX1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC70Q6NSX1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC70Q6NSX1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC70Q6NSX1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC70Q6NSX1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC70Q6NSX1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC70Q6NSX1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC70Q6NSX1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC70Q6NSX1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC70Q6NSX1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC70Q6NSX1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC70Q6NSX1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC70Q6NSX1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC70Q6NSX1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC70Q6NSX1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC70Q6NSX1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC70Q6NSX1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC70Q6NSX1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC70Q6NSX1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC70Q6NSX1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC70Q6NSX1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC70Q6NSX1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC70Q6NSX1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC70Q6NSX1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC70Q6NSX1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC70Q6NSX1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC70Q6NSX1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC70Q6NSX1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC70Q6NSX1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC70Q6NSX1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC70Q6NSX1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC70Q6NSX1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC70Q6NSX1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC70Q6NSX1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC70Q6NSX1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC70Q6NSX1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC70Q6NSX1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC70Q6NSX1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC70Q6NSX1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC70Q6NSX1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC70Q6NSX1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC70Q6NSX1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC70Q6NSX1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC70Q6NSX1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC70Q6NSX1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC70Q6NSX1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC70Q6NSX1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC70Q6NSX1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC70Q6NSX1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC70Q6NSX1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC70Q6NSX1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC70Q6NSX1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC70Q6NSX1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC70Q6NSX1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC70Q6NSX1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC70Q6NSX1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC70Q6NSX1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC70Q6NSX1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC70Q6NSX1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC70Q6NSX1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC70Q6NSX1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC70Q6NSX1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCDC70Q6NSX1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCDC70Q6NSX1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC70Q6NSX1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC70Q6NSX1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC70Q6NSX1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC70Q6NSX1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC70Q6NSX1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC70Q6NSX1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC70Q6NSX1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC70Q6NSX1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC70Q6NSX1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC70Q6NSX1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC70Q6NSX1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC70Q6NSX1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC70Q6NSX1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC70Q6NSX1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC70Q6NSX1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms