Protein–RNA interactions for Protein: Q6DKI2

LGALS9C, Galectin-9C, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGALS9CQ6DKI2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LGALS9CQ6DKI2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LGALS9CQ6DKI2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LGALS9CQ6DKI2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LGALS9CQ6DKI2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LGALS9CQ6DKI2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LGALS9CQ6DKI2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
LGALS9CQ6DKI2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LGALS9CQ6DKI2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LGALS9CQ6DKI2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LGALS9CQ6DKI2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LGALS9CQ6DKI2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LGALS9CQ6DKI2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LGALS9CQ6DKI2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LGALS9CQ6DKI2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LGALS9CQ6DKI2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LGALS9CQ6DKI2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LGALS9CQ6DKI2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LGALS9CQ6DKI2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LGALS9CQ6DKI2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LGALS9CQ6DKI2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LGALS9CQ6DKI2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LGALS9CQ6DKI2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LGALS9CQ6DKI2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LGALS9CQ6DKI2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LGALS9CQ6DKI2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LGALS9CQ6DKI2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LGALS9CQ6DKI2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LGALS9CQ6DKI2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LGALS9CQ6DKI2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LGALS9CQ6DKI2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LGALS9CQ6DKI2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LGALS9CQ6DKI2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LGALS9CQ6DKI2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LGALS9CQ6DKI2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LGALS9CQ6DKI2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LGALS9CQ6DKI2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LGALS9CQ6DKI2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LGALS9CQ6DKI2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LGALS9CQ6DKI2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LGALS9CQ6DKI2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LGALS9CQ6DKI2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LGALS9CQ6DKI2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LGALS9CQ6DKI2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LGALS9CQ6DKI2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LGALS9CQ6DKI2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LGALS9CQ6DKI2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LGALS9CQ6DKI2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LGALS9CQ6DKI2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LGALS9CQ6DKI2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LGALS9CQ6DKI2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LGALS9CQ6DKI2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LGALS9CQ6DKI2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LGALS9CQ6DKI2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
LGALS9CQ6DKI2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LGALS9CQ6DKI2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LGALS9CQ6DKI2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LGALS9CQ6DKI2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LGALS9CQ6DKI2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LGALS9CQ6DKI2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LGALS9CQ6DKI2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LGALS9CQ6DKI2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LGALS9CQ6DKI2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LGALS9CQ6DKI2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LGALS9CQ6DKI2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
LGALS9CQ6DKI2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LGALS9CQ6DKI2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LGALS9CQ6DKI2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LGALS9CQ6DKI2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LGALS9CQ6DKI2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LGALS9CQ6DKI2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LGALS9CQ6DKI2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LGALS9CQ6DKI2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LGALS9CQ6DKI2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LGALS9CQ6DKI2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LGALS9CQ6DKI2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LGALS9CQ6DKI2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LGALS9CQ6DKI2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LGALS9CQ6DKI2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LGALS9CQ6DKI2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LGALS9CQ6DKI2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LGALS9CQ6DKI2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LGALS9CQ6DKI2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LGALS9CQ6DKI2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LGALS9CQ6DKI2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LGALS9CQ6DKI2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LGALS9CQ6DKI2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LGALS9CQ6DKI2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LGALS9CQ6DKI2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LGALS9CQ6DKI2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LGALS9CQ6DKI2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LGALS9CQ6DKI2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LGALS9CQ6DKI2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LGALS9CQ6DKI2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LGALS9CQ6DKI2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LGALS9CQ6DKI2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LGALS9CQ6DKI2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LGALS9CQ6DKI2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LGALS9CQ6DKI2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LGALS9CQ6DKI2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms