Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
ECM29Q5VYK3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
ECM29Q5VYK3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
ECM29Q5VYK3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
ECM29Q5VYK3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
ECM29Q5VYK3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC31.62■■■□□ 2.65
ECM29Q5VYK3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
ECM29Q5VYK3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
ECM29Q5VYK3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
ECM29Q5VYK3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
ECM29Q5VYK3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
ECM29Q5VYK3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
ECM29Q5VYK3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
ECM29Q5VYK3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
ECM29Q5VYK3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
ECM29Q5VYK3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
ECM29Q5VYK3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
ECM29Q5VYK3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
ECM29Q5VYK3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
ECM29Q5VYK3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
ECM29Q5VYK3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
ECM29Q5VYK3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
ECM29Q5VYK3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
ECM29Q5VYK3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
ECM29Q5VYK3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
ECM29Q5VYK3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
ECM29Q5VYK3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
ECM29Q5VYK3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
ECM29Q5VYK3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
ECM29Q5VYK3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
ECM29Q5VYK3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
ECM29Q5VYK3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
ECM29Q5VYK3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
ECM29Q5VYK3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC31.48■■■□□ 2.63
ECM29Q5VYK3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
ECM29Q5VYK3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
ECM29Q5VYK3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
ECM29Q5VYK3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
ECM29Q5VYK3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
ECM29Q5VYK3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
ECM29Q5VYK3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
ECM29Q5VYK3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
ECM29Q5VYK3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
ECM29Q5VYK3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
ECM29Q5VYK3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
ECM29Q5VYK3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
ECM29Q5VYK3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.62
ECM29Q5VYK3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
ECM29Q5VYK3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
ECM29Q5VYK3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
ECM29Q5VYK3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
ECM29Q5VYK3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
ECM29Q5VYK3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
ECM29Q5VYK3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
ECM29Q5VYK3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
ECM29Q5VYK3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
ECM29Q5VYK3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
ECM29Q5VYK3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
ECM29Q5VYK3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
ECM29Q5VYK3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
ECM29Q5VYK3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
ECM29Q5VYK3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
ECM29Q5VYK3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
ECM29Q5VYK3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
ECM29Q5VYK3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
ECM29Q5VYK3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
ECM29Q5VYK3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
ECM29Q5VYK3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
ECM29Q5VYK3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
ECM29Q5VYK3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
ECM29Q5VYK3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
ECM29Q5VYK3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
ECM29Q5VYK3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
ECM29Q5VYK3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
ECM29Q5VYK3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
ECM29Q5VYK3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
ECM29Q5VYK3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
ECM29Q5VYK3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
ECM29Q5VYK3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
ECM29Q5VYK3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
ECM29Q5VYK3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
ECM29Q5VYK3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
ECM29Q5VYK3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
ECM29Q5VYK3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
ECM29Q5VYK3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
ECM29Q5VYK3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
ECM29Q5VYK3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
ECM29Q5VYK3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
ECM29Q5VYK3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
ECM29Q5VYK3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
ECM29Q5VYK3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC31.31■■■□□ 2.6
ECM29Q5VYK3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
ECM29Q5VYK3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
ECM29Q5VYK3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
ECM29Q5VYK3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
ECM29Q5VYK3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
ECM29Q5VYK3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
ECM29Q5VYK3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
ECM29Q5VYK3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
ECM29Q5VYK3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms