Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C9orf135Q5VTT2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C9orf135Q5VTT2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C9orf135Q5VTT2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C9orf135Q5VTT2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C9orf135Q5VTT2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C9orf135Q5VTT2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C9orf135Q5VTT2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C9orf135Q5VTT2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C9orf135Q5VTT2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C9orf135Q5VTT2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C9orf135Q5VTT2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C9orf135Q5VTT2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C9orf135Q5VTT2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C9orf135Q5VTT2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C9orf135Q5VTT2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C9orf135Q5VTT2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
C9orf135Q5VTT2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C9orf135Q5VTT2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
C9orf135Q5VTT2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
C9orf135Q5VTT2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C9orf135Q5VTT2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C9orf135Q5VTT2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C9orf135Q5VTT2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C9orf135Q5VTT2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C9orf135Q5VTT2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C9orf135Q5VTT2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C9orf135Q5VTT2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C9orf135Q5VTT2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C9orf135Q5VTT2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C9orf135Q5VTT2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C9orf135Q5VTT2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C9orf135Q5VTT2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C9orf135Q5VTT2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C9orf135Q5VTT2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C9orf135Q5VTT2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C9orf135Q5VTT2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C9orf135Q5VTT2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9orf135Q5VTT2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9orf135Q5VTT2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9orf135Q5VTT2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
C9orf135Q5VTT2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9orf135Q5VTT2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C9orf135Q5VTT2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
C9orf135Q5VTT2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
C9orf135Q5VTT2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C9orf135Q5VTT2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C9orf135Q5VTT2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C9orf135Q5VTT2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C9orf135Q5VTT2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C9orf135Q5VTT2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C9orf135Q5VTT2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C9orf135Q5VTT2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C9orf135Q5VTT2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C9orf135Q5VTT2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C9orf135Q5VTT2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
C9orf135Q5VTT2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C9orf135Q5VTT2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C9orf135Q5VTT2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C9orf135Q5VTT2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C9orf135Q5VTT2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C9orf135Q5VTT2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C9orf135Q5VTT2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C9orf135Q5VTT2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C9orf135Q5VTT2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C9orf135Q5VTT2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C9orf135Q5VTT2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C9orf135Q5VTT2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C9orf135Q5VTT2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C9orf135Q5VTT2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C9orf135Q5VTT2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C9orf135Q5VTT2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C9orf135Q5VTT2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C9orf135Q5VTT2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C9orf135Q5VTT2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C9orf135Q5VTT2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C9orf135Q5VTT2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C9orf135Q5VTT2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C9orf135Q5VTT2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C9orf135Q5VTT2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
C9orf135Q5VTT2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C9orf135Q5VTT2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C9orf135Q5VTT2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C9orf135Q5VTT2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C9orf135Q5VTT2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C9orf135Q5VTT2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C9orf135Q5VTT2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C9orf135Q5VTT2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C9orf135Q5VTT2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C9orf135Q5VTT2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C9orf135Q5VTT2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C9orf135Q5VTT2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C9orf135Q5VTT2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C9orf135Q5VTT2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C9orf135Q5VTT2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
C9orf135Q5VTT2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C9orf135Q5VTT2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
C9orf135Q5VTT2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
C9orf135Q5VTT2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C9orf135Q5VTT2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms