Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTE0

EEF1A1P5, Putative elongation factor 1-alpha-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1A1P5Q5VTE0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EEF1A1P5Q5VTE0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EEF1A1P5Q5VTE0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EEF1A1P5Q5VTE0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EEF1A1P5Q5VTE0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EEF1A1P5Q5VTE0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EEF1A1P5Q5VTE0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
EEF1A1P5Q5VTE0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EEF1A1P5Q5VTE0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EEF1A1P5Q5VTE0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EEF1A1P5Q5VTE0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EEF1A1P5Q5VTE0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EEF1A1P5Q5VTE0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EEF1A1P5Q5VTE0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
EEF1A1P5Q5VTE0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
EEF1A1P5Q5VTE0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
EEF1A1P5Q5VTE0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EEF1A1P5Q5VTE0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EEF1A1P5Q5VTE0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EEF1A1P5Q5VTE0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EEF1A1P5Q5VTE0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EEF1A1P5Q5VTE0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EEF1A1P5Q5VTE0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EEF1A1P5Q5VTE0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EEF1A1P5Q5VTE0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EEF1A1P5Q5VTE0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EEF1A1P5Q5VTE0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EEF1A1P5Q5VTE0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EEF1A1P5Q5VTE0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EEF1A1P5Q5VTE0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EEF1A1P5Q5VTE0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EEF1A1P5Q5VTE0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EEF1A1P5Q5VTE0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EEF1A1P5Q5VTE0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EEF1A1P5Q5VTE0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EEF1A1P5Q5VTE0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EEF1A1P5Q5VTE0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EEF1A1P5Q5VTE0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EEF1A1P5Q5VTE0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EEF1A1P5Q5VTE0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
EEF1A1P5Q5VTE0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EEF1A1P5Q5VTE0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EEF1A1P5Q5VTE0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EEF1A1P5Q5VTE0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EEF1A1P5Q5VTE0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EEF1A1P5Q5VTE0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EEF1A1P5Q5VTE0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
EEF1A1P5Q5VTE0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
EEF1A1P5Q5VTE0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EEF1A1P5Q5VTE0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EEF1A1P5Q5VTE0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EEF1A1P5Q5VTE0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EEF1A1P5Q5VTE0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EEF1A1P5Q5VTE0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EEF1A1P5Q5VTE0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EEF1A1P5Q5VTE0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
EEF1A1P5Q5VTE0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EEF1A1P5Q5VTE0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EEF1A1P5Q5VTE0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EEF1A1P5Q5VTE0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EEF1A1P5Q5VTE0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EEF1A1P5Q5VTE0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EEF1A1P5Q5VTE0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EEF1A1P5Q5VTE0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EEF1A1P5Q5VTE0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EEF1A1P5Q5VTE0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EEF1A1P5Q5VTE0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EEF1A1P5Q5VTE0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EEF1A1P5Q5VTE0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EEF1A1P5Q5VTE0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EEF1A1P5Q5VTE0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EEF1A1P5Q5VTE0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EEF1A1P5Q5VTE0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EEF1A1P5Q5VTE0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
EEF1A1P5Q5VTE0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EEF1A1P5Q5VTE0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EEF1A1P5Q5VTE0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EEF1A1P5Q5VTE0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EEF1A1P5Q5VTE0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EEF1A1P5Q5VTE0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EEF1A1P5Q5VTE0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EEF1A1P5Q5VTE0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EEF1A1P5Q5VTE0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EEF1A1P5Q5VTE0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EEF1A1P5Q5VTE0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EEF1A1P5Q5VTE0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EEF1A1P5Q5VTE0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EEF1A1P5Q5VTE0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
EEF1A1P5Q5VTE0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EEF1A1P5Q5VTE0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EEF1A1P5Q5VTE0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EEF1A1P5Q5VTE0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EEF1A1P5Q5VTE0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
EEF1A1P5Q5VTE0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EEF1A1P5Q5VTE0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EEF1A1P5Q5VTE0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EEF1A1P5Q5VTE0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EEF1A1P5Q5VTE0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EEF1A1P5Q5VTE0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EEF1A1P5Q5VTE0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms