Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3C3

TMEM164, Transmembrane protein 164, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM164Q5U3C3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM164Q5U3C3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM164Q5U3C3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TMEM164Q5U3C3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
TMEM164Q5U3C3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM164Q5U3C3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM164Q5U3C3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM164Q5U3C3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM164Q5U3C3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM164Q5U3C3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM164Q5U3C3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM164Q5U3C3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM164Q5U3C3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM164Q5U3C3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM164Q5U3C3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM164Q5U3C3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM164Q5U3C3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM164Q5U3C3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM164Q5U3C3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM164Q5U3C3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM164Q5U3C3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM164Q5U3C3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM164Q5U3C3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM164Q5U3C3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM164Q5U3C3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM164Q5U3C3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM164Q5U3C3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM164Q5U3C3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM164Q5U3C3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM164Q5U3C3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM164Q5U3C3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM164Q5U3C3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM164Q5U3C3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM164Q5U3C3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM164Q5U3C3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM164Q5U3C3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM164Q5U3C3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM164Q5U3C3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TMEM164Q5U3C3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM164Q5U3C3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM164Q5U3C3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM164Q5U3C3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM164Q5U3C3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM164Q5U3C3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM164Q5U3C3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM164Q5U3C3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM164Q5U3C3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM164Q5U3C3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM164Q5U3C3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM164Q5U3C3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM164Q5U3C3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM164Q5U3C3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM164Q5U3C3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM164Q5U3C3 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM164Q5U3C3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM164Q5U3C3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM164Q5U3C3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM164Q5U3C3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM164Q5U3C3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM164Q5U3C3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMEM164Q5U3C3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM164Q5U3C3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM164Q5U3C3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM164Q5U3C3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM164Q5U3C3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM164Q5U3C3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM164Q5U3C3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM164Q5U3C3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM164Q5U3C3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM164Q5U3C3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM164Q5U3C3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM164Q5U3C3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM164Q5U3C3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM164Q5U3C3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM164Q5U3C3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM164Q5U3C3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM164Q5U3C3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM164Q5U3C3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM164Q5U3C3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM164Q5U3C3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM164Q5U3C3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM164Q5U3C3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM164Q5U3C3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM164Q5U3C3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM164Q5U3C3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM164Q5U3C3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM164Q5U3C3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM164Q5U3C3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM164Q5U3C3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM164Q5U3C3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM164Q5U3C3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM164Q5U3C3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM164Q5U3C3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM164Q5U3C3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM164Q5U3C3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM164Q5U3C3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM164Q5U3C3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM164Q5U3C3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM164Q5U3C3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM164Q5U3C3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms