Protein–RNA interactions for Protein: Q5QFB9

PAPPA-AS1, Protein PAPPAS, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPPA-AS1Q5QFB9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAPPA-AS1Q5QFB9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAPPA-AS1Q5QFB9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAPPA-AS1Q5QFB9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAPPA-AS1Q5QFB9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAPPA-AS1Q5QFB9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAPPA-AS1Q5QFB9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAPPA-AS1Q5QFB9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAPPA-AS1Q5QFB9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAPPA-AS1Q5QFB9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PAPPA-AS1Q5QFB9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAPPA-AS1Q5QFB9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAPPA-AS1Q5QFB9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAPPA-AS1Q5QFB9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAPPA-AS1Q5QFB9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAPPA-AS1Q5QFB9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAPPA-AS1Q5QFB9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PAPPA-AS1Q5QFB9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PAPPA-AS1Q5QFB9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAPPA-AS1Q5QFB9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAPPA-AS1Q5QFB9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAPPA-AS1Q5QFB9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAPPA-AS1Q5QFB9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAPPA-AS1Q5QFB9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAPPA-AS1Q5QFB9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAPPA-AS1Q5QFB9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAPPA-AS1Q5QFB9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAPPA-AS1Q5QFB9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PAPPA-AS1Q5QFB9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAPPA-AS1Q5QFB9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAPPA-AS1Q5QFB9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAPPA-AS1Q5QFB9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAPPA-AS1Q5QFB9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAPPA-AS1Q5QFB9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAPPA-AS1Q5QFB9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAPPA-AS1Q5QFB9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAPPA-AS1Q5QFB9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAPPA-AS1Q5QFB9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAPPA-AS1Q5QFB9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAPPA-AS1Q5QFB9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAPPA-AS1Q5QFB9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAPPA-AS1Q5QFB9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAPPA-AS1Q5QFB9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAPPA-AS1Q5QFB9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAPPA-AS1Q5QFB9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAPPA-AS1Q5QFB9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PAPPA-AS1Q5QFB9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PAPPA-AS1Q5QFB9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PAPPA-AS1Q5QFB9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PAPPA-AS1Q5QFB9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PAPPA-AS1Q5QFB9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PAPPA-AS1Q5QFB9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PAPPA-AS1Q5QFB9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PAPPA-AS1Q5QFB9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAPPA-AS1Q5QFB9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAPPA-AS1Q5QFB9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAPPA-AS1Q5QFB9 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAPPA-AS1Q5QFB9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAPPA-AS1Q5QFB9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAPPA-AS1Q5QFB9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAPPA-AS1Q5QFB9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PAPPA-AS1Q5QFB9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PAPPA-AS1Q5QFB9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PAPPA-AS1Q5QFB9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PAPPA-AS1Q5QFB9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PAPPA-AS1Q5QFB9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PAPPA-AS1Q5QFB9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PAPPA-AS1Q5QFB9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PAPPA-AS1Q5QFB9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAPPA-AS1Q5QFB9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAPPA-AS1Q5QFB9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PAPPA-AS1Q5QFB9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PAPPA-AS1Q5QFB9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PAPPA-AS1Q5QFB9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PAPPA-AS1Q5QFB9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PAPPA-AS1Q5QFB9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PAPPA-AS1Q5QFB9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PAPPA-AS1Q5QFB9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PAPPA-AS1Q5QFB9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PAPPA-AS1Q5QFB9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PAPPA-AS1Q5QFB9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PAPPA-AS1Q5QFB9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PAPPA-AS1Q5QFB9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAPPA-AS1Q5QFB9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAPPA-AS1Q5QFB9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAPPA-AS1Q5QFB9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PAPPA-AS1Q5QFB9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAPPA-AS1Q5QFB9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAPPA-AS1Q5QFB9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAPPA-AS1Q5QFB9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAPPA-AS1Q5QFB9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAPPA-AS1Q5QFB9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAPPA-AS1Q5QFB9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAPPA-AS1Q5QFB9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAPPA-AS1Q5QFB9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PAPPA-AS1Q5QFB9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PAPPA-AS1Q5QFB9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PAPPA-AS1Q5QFB9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms