Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KCNT1Q5JUK3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KCNT1Q5JUK3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KCNT1Q5JUK3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KCNT1Q5JUK3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KCNT1Q5JUK3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KCNT1Q5JUK3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KCNT1Q5JUK3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KCNT1Q5JUK3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KCNT1Q5JUK3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KCNT1Q5JUK3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KCNT1Q5JUK3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KCNT1Q5JUK3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KCNT1Q5JUK3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KCNT1Q5JUK3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KCNT1Q5JUK3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KCNT1Q5JUK3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KCNT1Q5JUK3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KCNT1Q5JUK3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
KCNT1Q5JUK3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KCNT1Q5JUK3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KCNT1Q5JUK3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KCNT1Q5JUK3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
KCNT1Q5JUK3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KCNT1Q5JUK3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KCNT1Q5JUK3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KCNT1Q5JUK3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KCNT1Q5JUK3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KCNT1Q5JUK3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KCNT1Q5JUK3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KCNT1Q5JUK3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
KCNT1Q5JUK3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KCNT1Q5JUK3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
KCNT1Q5JUK3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KCNT1Q5JUK3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KCNT1Q5JUK3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNT1Q5JUK3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNT1Q5JUK3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNT1Q5JUK3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNT1Q5JUK3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNT1Q5JUK3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNT1Q5JUK3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNT1Q5JUK3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNT1Q5JUK3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNT1Q5JUK3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNT1Q5JUK3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNT1Q5JUK3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNT1Q5JUK3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNT1Q5JUK3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNT1Q5JUK3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNT1Q5JUK3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KCNT1Q5JUK3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KCNT1Q5JUK3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KCNT1Q5JUK3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KCNT1Q5JUK3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KCNT1Q5JUK3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KCNT1Q5JUK3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KCNT1Q5JUK3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KCNT1Q5JUK3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KCNT1Q5JUK3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KCNT1Q5JUK3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KCNT1Q5JUK3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KCNT1Q5JUK3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KCNT1Q5JUK3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KCNT1Q5JUK3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KCNT1Q5JUK3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KCNT1Q5JUK3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
KCNT1Q5JUK3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KCNT1Q5JUK3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KCNT1Q5JUK3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KCNT1Q5JUK3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KCNT1Q5JUK3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KCNT1Q5JUK3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KCNT1Q5JUK3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KCNT1Q5JUK3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KCNT1Q5JUK3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
KCNT1Q5JUK3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KCNT1Q5JUK3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KCNT1Q5JUK3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
KCNT1Q5JUK3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KCNT1Q5JUK3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KCNT1Q5JUK3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KCNT1Q5JUK3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KCNT1Q5JUK3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KCNT1Q5JUK3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KCNT1Q5JUK3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KCNT1Q5JUK3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KCNT1Q5JUK3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KCNT1Q5JUK3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
KCNT1Q5JUK3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
KCNT1Q5JUK3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
KCNT1Q5JUK3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
KCNT1Q5JUK3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
KCNT1Q5JUK3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KCNT1Q5JUK3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KCNT1Q5JUK3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KCNT1Q5JUK3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KCNT1Q5JUK3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KCNT1Q5JUK3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KCNT1Q5JUK3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms